深山中，一老一少在打斗着，少的是徒弟叫孟元超，老的是师父名吕寿琨。师父让徒弟下山投靠结拜兄弟威武镖行总镖头云在山。孟元超对云在山女儿云紫萝有些心动。在云夫人的说明下，孟元超知道云在山早已病故。

镖行接到一宗奇怪的生意，要把一个新娘送到夫家去，原来这新娘被一个流浪剑客缪长风纠缠不休。令云紫萝意想不到的是，孟元超竟然是他指腹为婚的夫婿。

云紫萝向宋腾霄表明自己对他只有兄妹之情。宋家和云家从此交恶。吕寿琨为不祸及孟元超，携女儿吕思美匿藏起来。云紫萝被采花贼荣以药迷倒，在药的影响下，她与孟元超二人私订了终身。吕寿琨遇缪长风，不敌。便要缪长风向他徒弟孟元超挑战，待五年后较量。孟元超终寻回吕寿琨，发现吕寿琨死在石朝玑手中。在缪长风的帮助下，孟元超把石朝玑引到悬崖边，准备和石朝玑决一死战。

孟元超与石朝玑一同坠下万丈悬涯，生死未卜。云紫萝回到了威武镖行。不久，便发现自己已经怀孕，而孟元超却是音讯全无。云夫人知道这件事后，只好等孟元超回来。

吕思美向云紫萝说出孟元超的死讯。北宫望一直认为吕寿琨藏着一个宝物，便跟踪吕思美来到威武钵行。他以为宝物藏在镖行之内，下令查封镖行。宋腾霄通知云紫萝和云夫人逃走。云紫梦和云夫人，宋腾霄和吕思美失散。

宋腾霄父亲宋时伦亦被北宫望押到天牢。而孟元超则大难不死，顺着河道漂到飞鱼滩，遇一少女林元双。飞鱼滩是一个名为扶桑派派别的大本营。林无双是飞鱼滩的传人，她爹死后，由林无双继承了整个飞鱼滩。但林无双却听命于他的表哥牟宗涛，还对表哥情根深种。林无双救了来自中原的孟元超，差点被牟宗涛杀了，幸得林无双相助。吕思美和宋腾霄回去查看家里情况时，被北宫望抓了。

吕思美骗北宫望宝物在师兄孟元超手里。北宫望最后放了吕思美和宋腾霄。云紫梦和云夫人途中遇山贼，幸得一青年相助脱险。这青年是龙门镖行总镖头机制牧。杨牧与姐姐杨大姑相依为命。杨大姑的叔公是御林军统领北宫望的左右手四海神龙齐建业。杨牧对云紫梦一见倾心，誓将云紫梦得到手。林无双看到孟元超戴着的一个饰物--小玉笛子。这小玉笛子内藏着一幅微型的藏宝图，宝藏是夫子派之宝。

孟元超的伤终于好了，与林无双乘船回到中原。缪长风带着孟元超的口信却没有找到云紫萝，在酒馆买醉延误了找人的时间。云紫萝因孟元超生死不明，肚里的孩子又不能等，于是下嫁给杨牧。

孟元超见到云紫萝时，她已经成为别人的妻子。孟元超黯然离开，却遇到了缪长风。另一方面，林无双找到牟宗涛，却了现了持有异议派内乱频生。缪长风带了孟元超去御林军府的宝藏室寻药治伤，孟元超看取了一件浮雕，正好与自己佩戴的玉笛相配。这时，北宫望突然出现了。

孟元超被北宫望擒住了，北宫望抢走玉笛子，想杀了孟元超灭口，远交近攻好缪长风及时出手相救。孟元超知道玉笛子是宝藏的线索，父亲之死以及扶桑派兴衰都与这宝藏有关联，于是决定找林无双寻宝。扶桑派内斗不止，林无双站在牟宗涛一边，但她却不知道牟宗涛是在利用她。孟元超与林无双在岳山找到宝藏，结果被突然出现的北宫望困在藏宝的山洞中。

武林大会开始，杨牧好奇，带着云紫萝去看热闹。林无双和孟元超在山洞中习得绝世武功，并成功逃离了山洞。这时扶桑派工宗立派的仪式也开始了，牟宗涛凭着师妹练彩虹的帮助，大败宗神龙，成了扶桑派的候任掌门。牟宗涛趁机把宗神龙与叶堂主杀掉，还说二人因为私仇而两败俱伤。孟元超和林无双赶到，看到宗神龙的尸体上有牟宗涛留下的痕迹。

孟元超和林无双感到牟宗涛是凶手，但苦无证据。第二天，牟宗涛正要登上极位时，林无双向他挑战。林无双狙击着从石壁上学来的功夫在孟元超的帮助下打败了牟宗涛，并当上了扶桑派的掌门。北宫望暗中看到这一幕，打算用乾坤大法的武功夺走林无双与孟元超的功力。

云紫萝因与杨牧争执而流产了，她说孩子是孟元超的，随后离开了龙门镖行。北宫望为得到林和孟的功力，勾结规章的牟宗涛。孟元超在岳山大会上扬名，师妹吕思美和宋腾霄找上门来，众人重聚。在缪长风的帮助下，孟元超决定创办飞扬镖行，秉承父亲的遗志。孟元超与林无又得知卧虎岗是个贼窝，联手把山贼打得落花流水，以此扬威立万。

杨牧亿借云紫萝的母亲云夫人病重为由骗云紫萝，并用化功散之毒将云紫萝软禁在镖行内。牟宗涛在卧虎岗一役中受了伤，从而搏取了林无双的信任。宋腾霄向吕思美表白爱意，吕军民美因为自己是江湖儿女，不想当官宦人家的媳妇所以拒绝了。

缪长风到了龙门镖行，动武救出云紫萝，并斥责杨牧卑鄙。这时，孟元超的镖行恰好接了一趟镖，其实是中州村行设的陷阱，想以此教训孟元超。孟元超和吕思美一块上路押镖，这时宋腾霄追来，在孟元超的帮助下，吕思美和宋腾霄终于订下鸳盟。

途中，押的镖奇怪失踪。缪长风赶来，查出这是中州镖行做的手脚，他联同孟元超揭穿了阴谋。林无双来访，找孟元超钻研石壁上的功夫，不想竟走火入魔不能动弹。孟元超运功助她脱险，不想被云紫萝看见，以为两人有苟且行为。云紫萝不给孟元超解释的机会，两人误会加深。

林无双回到帮中撞破了练彩虹和牟宗涛的私情，含恨而走。北宫望和牟宗涛乔装成一般武林人士，把猝不及防的扶桑派打败，还生擒了林无双，北宫望失利了东海明珠，这时，孟元超赶来，解救了林无双。北宫望拿走东海明珠，而牟宗涛被赶出扶桑派。北宫望不肯接纳牟宗涛，牟只好转投北宫望的对手有萨福鼎六下。

云紫萝重开了威武镖行，缪长风来当镖师帮助她。有退休的官员想请孟元超保家眷财物告老还乡，孟元超邀请云紫萝一起保这趟镖。途中，孟和云两人发现了中州镖行勾结强盗的证据，于是抓了中州镖行镖行的方大鹏总镖头。北宫望和齐建业为了毁灭证据，杀了方大鹏。

缪长风不知不觉中喜欢上云紫萝，心中非常郁闷。中秋节，北宫望找到缪长风一起喝酒，酒醉之下吐露缪长风是他的私生子。牟宗涛自从投靠了萨福鼎后，成了萨福鼎的左右手。北宫望知道缪长风任镖师了，就透过第三者把玉浮雕交给了威武镖行托运到京城去，还反映定缪长风为押运者，给他立功的机会。

萨福鼎要行刺北宫望，牟宗涛却向北宫望投诚。孟元超继承了父亲的遗志，要建立一个十三省镖行为联盟。杨牧劫持云夫人，并以此要挟云紫萝在结盟大会上指证孟元超勾引良家妇女。远交近攻而缪长风暗中相助，救出云夫人，杨牧身败名裂。孟元超知道云紫萝是为了自己牺牲良多，要求复合，云紫萝拒绝了。

牟宗涛得知北宫望是孟元超的杀父仇人，为了从中牟利，他将此事告诉孟元超。北宫望乾坤大法已经练得差不多，竟利用缪长风引孟元超出现，并市政陷阱将孟元超抓住。北宫望先化去了自己的一身功力，然后吸取孟元超的内力，此时缪长风却冲进了密室解救了孟元超。

孟元超乘着北宫望分心的时候，当场将他杀死。缪长风眼看自己的生父被杀了痛心不已，想为父报仇，但自己也受了重伤，云紫萝把他送到扶桑派治疗。缪长风本要找孟元超报复，得在云紫萝的劝说下终于想通了。北宫望死后，杨牧的师傅齐建业想何时一次押镖来监守自盗，不想反被牟宗涛和杨牧扮山贼给杀掉了。

齐建业死了，中州镖行的总镖头就是牟宗涛，杨牧成了他暗中的助手。吕思美和宋腾霄定下婚期，准备大宴亲朋，牟宗涛和杨牧决定借这个机会均等来将所有人一网打尽。婚宴当日，宾客不少人中了毒，杨牧突然出现救了众人，还说一切都是牟宗涛所为，取得孟元超等人的谅解。其实，牟宗涛和杨牧酝酿一场更大的阴谋……

云夫人想撮合孟元超与自己的女儿云紫萝在一起，却发现桑青想撮合林无双与孟元超成为一对，忍不住与之争吵起来。云夫人无意中发现牟宗涛和杨牧要合谋用炸药炸毁镖行联盟大会场。结果被杀人灭口云夫人的尸体被发现，最大的娣犯就是曾经和云夫人争吵的林无双和桑青。云紫萝要为母报仇，却被孟元超所制止。

孟元超和缪长风追查之下，发现凶手另有其人。牟宗涛和杨牧怕事情败露竟然让牟的情人红彩虹作替死鬼。练彩虹为了爱人，死在牟宗涛的剑下。案件似乎告一段落了，林无双却决定私下再追查，为练彩虹雪冤。杨牧开始练毒掌，过程非常人所能忍受，但杨牧却挺了过来。

林无双和门人一起去抓牟宗涛，不想被杨牧破坏，功败垂成。林无双把杨牧帮助牟宗涛的事告诉孟元超，但杨牧的一番解释让孟元超对他的改过深信不疑。牟宗涛对杨牧的忠诚感到疑惑，他想借一次劫镖一除去杨牧，恰巧被孟元超和宋腾霄救下。云紫萝的青史和姨母来探望云紫萝，并向云紫萝提亲，被缪长风出手教训，因此惹怒了云紫萝。

十三省联盟大会始终无法达成一致，孟元超决定说服称霸一方的河朔镖行支持。河朔镖行的主人叫庄河岳，他女儿庄天心在进行比武招亲中阴差阳错之下与孟元超谛结了鸳盟。不料，庄天心却喜欢女扮男装的林无双。庄天心拒绝了孟元超，让河庄河岳觉自己有负孟元超，只好答允加盟孟元超号召的十三省镖行联盟大会。

牟宗涛相当上联盟盟主，用新练成的毒掌将林无双抓住了，想以此要挟孟元超。十三省联盟大会召开，牟宗涛和杨牧相断出现。牟宗涛一出现即表示中州镖行愿意和各镖行合作，还大洒落金钱，补偿曾被中州镖行欺压的镖行。牟暗中找到孟元超，表示若要林无双活命，就要推荐他当十三省联盟的盟主。牟宗涛出示佩刀，孟元超左右为难。