明朝天启年间，J臣当道百姓陷于水深火热之中，九千岁魏忠贤登天祭天路遇刺客，神机营杀手叶红影及时出手救出义父九千岁，东林党人意欲铲除宦孽惨遭灭门之灾，危急时刻马尚飞临危受命，答应顾宪成携幼主顾仁愿及官印逃离危险之地，花姨和杨冬晴帮助马尚飞和顾仁愿逃出了叶红影的追杀。

叶红影在和杨冬晴过招时认出了冬晴，冬晴开始寻找叶红影，袁崇焕得知东林书院惨遭灭门，愤慨不已决定从长计议，马尚飞携幼主顾仁愿及官印一路寻找袁崇焕将军，叶红影无意中与小偷结识，让他们找到马尚飞和顾仁愿身上的官印便赏银百两，小偷们把已经砍坏的官印拿给了叶红影，叶红影很生气，让他们七天之内找到孩子，九千岁来到江南被劫持，叶红影赶到救急，走在大街上的马尚飞和顾仁愿发现自己已被通缉。

叶红影告诉九千岁魏忠贤，官印虽然已经毁掉，但官印烙下的印纹已经烙印在孩子顾仁愿身上，马尚飞和顾仁愿来到醉月楼，被花姐留在了醉月楼帮忙，魏忠贤替叶红影做主，想让芳踪和叶红影在一起，叶红影心中放不下冬晴，又不好拒绝芳踪，告诉义父想把东林党的余孽斩尽杀绝后再和芳踪在一起，魏忠贤答应。有人在醉月楼门口放了大石头找麻烦，冬晴出面解决.

红影实在不能接受芳踪，便向芳踪说出心里的想法并回到客栈去住，马尚飞和曾爱娣开玩笑的时候无意中发现她是女儿之身，曾爱娣要他娶自己，可是马尚飞宁死不从，两人闹剧使醉月楼的客人看了一场好戏，花姐照顾被打伤的马尚飞并透露出好感，马尚飞惊慌失措的逃出她房间。

魏忠贤派人飞鸽传书通知叶红影截杀袁崇焕手下的十三铁骑;花姐教马尚飞练功夫但是他却一窍不通，风尘双侠刺杀叶红影失败想要带着顾仁愿去辽东，顾仁愿想出了一个能够掩护他们出城的方法，这一切计划都被曾爱娣的父亲看到，他还无意中将传信的飞鸽烤了，叶红影得知后非常生气，他就将在醉月楼听到的消息全部告诉了叶红影。

叶红影通知冬晴姑娘让她们尽快离开，不要插手风尘双侠的事情，冬晴姑娘怕连累红姐来向红姐告别，但是红姐劈头盖脸的骂了一通，红姐不怕被连累，因为她把冬晴当做亲妹妹一样对待，与风尘双侠接应的人不知他们已经落网，在混进城之后被叶红影杀害，并放信号弹误导其他同党准备并将他们杀人灭口。

杨涟入狱，叶红影前去探望启蒙恩师，杨涟苦口劝说红影改邪归正，终遭酷刑惨死。花姨告诉曾爱娣马尚飞是东林党的反贼，想让她离开马尚飞，曾爱娣却对马尚飞一心一意，顾仁愿和冬晴结拜为姐弟，在回家的路上冬晴看见了已被吊在大街上死去的父亲，欲救下父亲，叶红影打晕冬晴将其送回醉月楼，自称袁崇焕的十三铁骑来到醉月楼想把仁愿带走，花姨谨慎行事告诉他们仁愿已经不在醉月楼，冬晴醒来一心想要为爹收尸，被众人劝阻。

冬晴被花姨点住穴道，差点被黑衣人袭击，众人劝说下花姨解开冬晴穴道，冬晴立刻点住花姨出去给父亲收尸，马尚飞随后追出帮助冬晴，仁愿留下来帮助花姨解穴，最终在叶红影的帮助下，冬晴救出父亲的尸体，众人将杨涟下葬，曾爱娣的父亲看到了大家下葬杨涟，又看见街上有悬赏杨涟尸体的告示，本想去告密拿到赏钱孝敬师傅叶红影，却被叶红影制止。冬晴在救出父亲尸体后和叶红影对话，被十三铁骑其中之一听到，这个奄奄一息的人说出十三铁骑中必有内J，花姨和大家决定在醉月楼这自称是十三铁骑的这三个人当中找出内J，曾爱娣被花姨捆在醉月楼实则是暗中保护她。

曾庸抓到一只从醉月楼飞出的带着“醉月楼可疑”纸条的信鸽交给叶红影，花姨回忆起和故名将熊廷弼的相识相知过程，决定让马尚飞做她家的关门弟子，让他负起一个男人应尽的责任，保护好醉月楼。顾仁愿在院子里玩弹弓，石破天与其搭讪仁愿差点露出破绽，大家都怀疑石破天就是内J，决定抛出假官印图文引诱石破天上钩，却有他人盗走图文被赶到醉月楼附近的叶红影杀掉，冬晴认为叶红影是其杀父仇人，欲将叶红影杀掉但内心却不忍，花姨用银针封住叶红影的穴道，仁愿苦苦哀求不要杀掉叶红影，大家将叶红影带到醉月楼关入了柴房。仁愿一心想救叶红影把他当好朋友，叶红影趁机想利用仁原找出冬晴他们想找的内J。

爱娣得罪了官府的人，为了不让爱娣出事花姐点了她的穴道不让她出醉月楼的门，叶红影(焦恩俊饰)身受重伤在柴房，他叫顾仁愿提防坏人，正巧夺命罗煞要杀害叶红影，关键时刻冬晴出现，夺命罗煞抓住顾仁愿到树林中，正逢马尚飞和红姐练功，于是将仁原救下，花姐和冬晴打退敌人。

潘汝桢逼冬晴嫁给自己，并且把醉月楼围得水泄不通，冬晴和花姐没有计策只能将计就计，她已经做好了与狗贼同归于尽的准备，花姐对潘汝桢说冬晴之前有过婚配，潘汝桢原本就对叶红影恨之入骨，得知冬晴的未婚夫婿是叶红影之后，更加要娶冬晴过门，花姐一看弄巧成拙无计可施，为了救出冬晴就只能尽快找到叶红影

潘汝桢等了许久的冬晴终于来到洞房，马尚飞和爱娣在门外观察情况，不小心闯了进去，冬晴让爱娣帮她找白蜡烛，在柴房两人想出办法就冬晴，两人用有药的酒把潘汝桢迷晕，仁愿为了救冬晴被夺命罗煞劫走，花姐中了毒镖，叶红影半路杀出，得知他是十三铁骑的叛徒将他杀掉带仁愿离开。

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爱娣穿好嫁衣在马尚飞的屋里想要跟他成亲洞房，可是马尚飞以种种理由推辞了，叶红影（焦恩俊饰）和冬晴（齐芳饰）一群人商量如何躲避巡抚的抓捕逃出城，因为巡抚不让人民化脸谱，一位道人帮他们出了一个主意，但是这件事情被一个小道士听见，为了拿到悬赏小道士将他们的计划告诉了潘汝桢，他派人拦住扮成道士的叶红影冬晴等人，却被曾庸（任正彬饰）假扮的叶红影引开。

皇上初登隆基请孙伯余杖责自己，此时魏忠贤擅自闯进，并对皇上毫无尊重想要趁机谋权，朝内大臣无不想要除掉这一J臣，但是最重要的就是找到顾老官印的下落，孙伯余向皇上举荐袁崇焕，让他助皇上一臂之力除掉魏忠贤，魏忠贤得知手下不少人都死于叶红影（焦恩俊饰）的手中，不相信叶红影会被判自己，仁愿和马尚飞（洪剑涛饰）扮成西域人进城被一个官差拦住，仁愿（杨志雯饰）机智的躲过了官差的纠缠。

爱娣上了人贩子的当被关了起来，要把她们卖掉，爱娣破笼而出带着姐妹们收拾人贩子，关键时刻冬晴（齐芳饰）带着官兵赶来，解救了爱娣，马尚飞（洪剑涛饰）和仁愿（杨志雯）到处打听扬名山庄，但是扬名山庄已经更名为折剑山庄十几年，无意中被叶红影（焦恩俊饰）的师妹战姑娘发现行踪，她误导他们扬名山庄的路线，并将消息报告给了官府的人，这一切都是为了二师兄能够得到庄主的位置。

叶红影（焦恩俊饰）虽保住了性命，但毕生所学的武功却忘得一干二净，二师兄姜遥北最终找到是药中的海螵蛸找错了，马尚飞（洪剑涛饰）和顾仁愿（杨志雯）因为找错了药而心怀愧疚，仁愿决定帮叶红影恢复记忆，马尚飞在缝补衣服的店铺遇上捕快，急忙飞上天逃出路遇东厂派来上任的公公筱剑仁，差点被净身。仁愿开始帮叶红影回忆过去，马尚飞却趁机让失去记忆的叶红影伺候自己，小师妹不希望大师兄叶红影留在折剑山庄，企图把叶红影赶出山庄却被姜遥北制止，在大街上遇到被革职的赵捕头，赵捕头告诉灵儿他们，朝廷派来了钦差大臣来上任。仁愿发现叶红影虽然不认识大家了，却熟背经书，马尚飞教他功夫他也学得很快。灵儿一心想赶走大师兄叶红影离开折剑山庄并希望师兄们帮助她。

折剑山庄庄主战天云（徐少强饰）回来了，制止了灵儿带领众师兄弟将叶红影（焦恩俊饰）送去官府的行为，厉公公（陈文波饰）面对五年一度的煮酒论剑比武大会，心怀不轨，战天云心中已经预感叶红影的到来将给折剑山庄带来危机，本决定取消煮酒论剑比武大会，想避免折剑山庄的这场灾难，却发现事已至此只能寻求善后之道。仁愿（杨志雯）发现自己吟诗作对，就能让叶红影回忆想起武功招数，决定帮叶红影恢复记忆和剑术。折剑山庄弟子孟宽被厉公公陷害利用，叶红影和仁愿去问战天云为何不愿让他恢复记忆。

折剑山庄弟子孟宽回来劝告师父战天云（徐少强饰）放弃煮酒论剑比武大会，战天云明白东厂插手此次大会就是冲着叶红影（焦恩俊饰）来的，折剑山庄的一场恶战不可避免，厉公公（陈文波饰）想和江湖大侠长空无名联手对付战天云和叶红影，被长空无名拒绝。叶红影早起为师父战天云煮粥，孟宽趁机下毒，战天云面对徒弟这碗粥心中感慨不已，喝下了这碗粥，身中剧毒后的战天云决定取消今日的煮酒论剑，厉公公硬闯折剑山庄，岳掌门咄咄相逼孟宽上前应战，孟宽被杀，厉公公上门侵门踏户杀徒伤人，战天云气愤至极。

战天云（徐少强饰）喝的粥里被人下毒，又被岳东来逼着签下生死状，如果输掉比武将自断双臂，叶红影（焦恩俊饰）得知情况却被马尚飞捆绑着无法逃脱，关键时刻仁愿（杨志雯饰）将叶红影松绑，失去记忆的叶红影在仁愿的提示下打败了岳东来，爱娣在路上为了救被欺压的异族而被官兵抓起来，冬晴为她求情无意中得知官兵是袁将军的部下，便一同去见袁将军。

冬晴（齐芳饰）和爱娣（秦旋饰）见到袁将军，袁将军想要除掉魏忠贤，便同意她二人去说服叶红影不与魏忠贤为伍，芳踪对魏忠贤说叶红影（焦恩俊饰）与潘汝桢反目都是因为杨冬晴，芳踪对叶红影一片痴心，魏忠贤答应要帮她找到叶红影，皇上要选妃，但是魏忠贤执意插手此事，皇上没有掌控实权只能选择忍耐，找到适当的时机将魏忠贤斩草除根。

战天云看出马尚飞（洪剑涛饰）是学轻功的料，但是由于他体型过于肥胖无法打开身体的穴位，马尚飞请战天云打开他身体的穴道练就绝世轻功，魏忠贤得知皇帝从来没有尝过他派人送去的点心和食物，认为皇帝对他已经有了疑心，并开始进行下一步计划，灵儿和二师兄认为是叶红影（焦恩俊饰）在师傅的粥里下毒，想要把他赶出折剑山庄。

孙大人被锦衣卫挟持，冬晴（齐芳饰）和曾爱娣（秦旋饰）正巧遇到救了孙大人，冬晴却受了伤。冬晴和爱娣又在街上救了差点从树上掉下小女孩，女孩的父亲墨竹带她们回家，让自己的妻子医治冬晴的伤。马尚飞（洪剑涛饰）把战天云（徐少强饰）让他在大厅匾额后藏信的事告诉了叶红影（焦恩俊饰），一旁的姜遥北听到后决定夜行盗走锦盒看信的内容，却被马尚飞和叶红影抓了现行，战天云很生气警告了姜遥北，并告诉众弟子折剑山庄庄主的人选将在他六十大寿时宣布。原来小女孩丹丹的母亲季雨莲，曾帮助魏忠贤（王新民饰）刺杀先帝，现在的季雨莲一心想过平静的日子，不想多惹是非，希望冬晴和爱娣尽早离开。魏芳踪（杨舒婷饰）夜晚独自喝醉路遇坏人，姜遥北出手相救，魏芳踪将其看成叶红影，姜遥北趁机玷污了魏芳踪，企图让自己的荣华富贵和官爵之路变得畅通无阻，魏芳踪气愤之极，姜遥北说自己会为魏芳踪做一切事情，并通过魏芳踪让自己当上了锦衣卫千户大人。

魏芳踪（杨舒婷饰）和姜遥北（李博饰）在官府门前说话，被战灵（陈姝饰）看到并知道了姜遥北投靠锦衣卫的事情，两人争吵下灵儿气愤的走掉，魏芳踪让姜遥北杀掉灵儿灭口。灵儿回到折剑山庄，叶红影（焦恩俊饰）看到有心事的灵儿便上前劝导，又把灵儿带到自己的房间中讨论，姜遥北趁叶红影离开屋子的时候杀死了灵儿，并把一切顺利的嫁祸给了叶红影。战天云（徐少强饰）把叶红影关了起来，心中却怀疑凶手另有他人，马尚飞（洪剑涛饰）和仁愿（杨志雯）决定帮助叶红影洗清冤屈，四处寻找证据。魏芳踪在姜遥北的安排下见到了失忆的叶红影，魏芳踪打晕姜遥北，劫走了叶红影。仁愿和马尚飞又来到灵儿的尸体前查看灵儿的伤口，寻找证据证明叶红影的清白。

魏芳踪（杨舒婷饰）告诉失忆的叶红影（焦恩俊饰）自己是冬晴，希望可以和叶红影从此永远在一起。马尚飞（洪剑涛饰）和仁愿（杨志雯）看到了灵儿伤口的形状，经过验证找到了凶手不是叶红影的证据。姜遥北（李博饰）看到仁愿找到证据，烧了灵儿的尸体企图毁尸灭迹。厉公公（陈文波饰）知道杀死自己未婚妻子的姜遥北是个很容易被利用的人，决定利用姜遥北步步为营，灭掉折剑山庄。冬晴（齐芳饰）和曾爱娣（秦旋饰）也来到了东口县，魏芳踪一路带着叶红影出城，被锦衣卫追杀，姜遥北和冬晴等都看到了二人，姜遥北阻止两人出城，告诉叶红影其实魏芳踪是假扮冬晴，魏芳踪气愤之极和姜遥北打了起来，穷凶极恶的姜遥北竟然杀死了魏芳踪。叶红影和冬晴见面了，叶红影也想起了冬晴是自己未过门的妻子，魏芳踪奄奄一息说出了自己对叶红影无尽的爱，也告诉冬晴自己才是杀死杨涟的人，叶红影带着魏芳踪回到折剑山庄希望战天云（徐少强饰）可以救魏芳踪，魏芳踪伤势太严重战天云无力回天，魏芳踪带着无尽的遗憾死在了叶红影的怀中，厉公公赶到折剑山庄要带走姜遥北，战天云拿出了最后一面免死铁券救下了姜遥北，并告诉厉公公要给自己一个给自己女儿报仇的机会，三日后用江湖规矩和叶红影决斗，希望厉公公成全。

厉公公逼战天云和叶红影进行角斗来了结“恩怨”以除掉叶红影（焦恩俊饰），战天云相信灵儿的死跟叶红影没有关系，但是仍然答应了厉公公了要求，只要叶红影赢了战天云便不再插手他们的事情，爱娣（秦旋饰）在折剑山庄找到马尚飞（洪剑涛饰）和仁愿，非常高兴，战天云因为已经消籍退官无力帮助冬晴（齐芳饰）为父亲报仇，心内十分内疚，冬晴表示理解，战天云不希望叶红影恢复记忆，并做好了牺牲自己的准备。

战天云（徐少强饰）为了救折剑山庄为了救叶红影还有更多的人死在了叶红影（焦恩俊饰）手中，看到了师父给他的信，叶红影深深的自责，失去记忆的叶红影才明白以前他所做的都是在为J臣做事，害死了许多忠良，厉公公不善罢甘休，听说折剑山庄有盘龙剑阵便挑拨折剑山庄的师兄弟借手除掉叶红影，叶红影和冬晴（齐芳饰）、马尚飞（洪剑涛饰）、仁愿（杨志雯）一行人走到野外碰到折剑山庄的师兄弟，发现师兄弟已经都投靠了锦衣卫，叶红影便与他们厮打起来。

叶红影（焦恩俊饰）身中巨毒，冬晴（齐芳饰）请求季姑娘为他解毒，再三请求之下，季姑娘终于肯出手相救，马尚飞（洪剑涛饰）带着爱娣（秦旋饰）轻功落到了皇宫里，两人扮成了太监在皇宫里游荡，魏忠贤身穿龙袍，满朝文武几乎全部成为他的党羽，魏忠贤心情尚佳宴请群臣，马尚飞和爱娣就混在上菜的太监中，不巧被厉公公（陈文波饰）碰见。

厉公公（陈文波饰）找到季雨莲，原来十年前的季雨莲是神机营第一女千户，魏忠贤（王新民饰）以她的丈夫、女儿要挟她为自己办事，厉公公又找到长空无名，告诉长空无名血刀要杀叶红影（焦恩俊饰），长空无名为了朋友叶红影，重上在了血刀手下，长空无名看清了血刀就是姜遥北（李博饰）。魏忠贤派出了季雨莲刺杀孙伯余，幸得叶红影和冬晴（齐芳饰）护送孙大人，叶红影看到奄奄一息的长空无名，救下他之后长空无名要他从自己身上的伤来破解血刀的招数。马尚飞（洪剑涛饰）和爱娣（秦旋饰）灌醉魏忠贤盗走钥匙，被群兵围攻的情形下叶红影出现救走二人，血刀出现和叶红影决斗，血刀输了之后仍不服气，自残自己另一条手臂，要厉公公为自己换上两条铁臂与叶红影再次决斗。马尚飞和爱娣带回来的东西是魏忠贤的龙袍和皇冠，魏忠贤和厉公公再次找来季雨莲，大家护送孙大人一同进宫面圣，魏忠贤想趁此机会将孙伯余、叶红影等人一网打尽。