东瀛第一剑客柳生一剑来到中原挑战各大门派，所向披靡，正道武林第一人武当掌门苍壁也败于其手。绿林大盗秦百川为了成为武林第一人拜入武当，道号苍松，身份被揭破后，依然得到苍壁的赏识，苍壁临终将掌门传于苍松，并留下对付柳生一剑,挽回中原武林颜面的计策。华山掌门楚莽依计挑战柳生一剑，使其得知魔教第一高手燕北飞的存在。

正道四大掌门一行去天山雪岭寻找燕北飞，却被吊桥上的毒雾所阻。苍松有胆有识，看破毒雾的玄机，因而受到燕北飞的赏识。原来燕北飞的妻子正是华山掌门楚莽的女儿楚心如，因嫁给燕北飞，楚心如与楚莽父女决裂多年。此时，柳生一剑寻至天山，要求与燕北飞一决高下，燕北飞以妻儿为重，尽管将与高手比试武功视为天下第二快事，仍然拒绝应战。

楚心如虽然和楚莽决裂多年，但一直牵挂着父亲，而楚莽等人希望通过挑战柳生一剑来是楚心如为父亲担心，从而迫使燕北飞应战。燕北飞看穿了这一点，但为了妻子依然答应与柳生决战，并提出决战后楚莽为两人补办婚礼的条件。柳生一剑出身农民之家，通过艰辛的努力与舍弃，成为扶桑第一高手，信奉无情无义无牵无挂的无情剑，而燕北飞却信奉挚爱妻儿的有情剑。此时柳生的妻子从扶桑赶来寻找柳生，为了成全柳生的无情剑甘愿死在了柳生剑下。燕北飞与柳生二人在雪山之巅展开决战。

决战之中，燕北飞用柳生的招式击败了柳生，但自己也受了重伤。中原武林趁机追杀柳生，柳生自尽于江畔。楚莽依约为燕北飞夫妇举办婚礼，苍松收到苍壁的遗命与楚莽等人在婚礼时刺杀燕北飞，以掩盖正道武林之耻。但苍松出于与燕北飞的情义，出手时偏离了要害。燕北飞明白苍松的苦衷，依然将儿子托付给苍松，随后几乎杀尽前来围攻的正派人士。但妻子楚心如却死于其父楚莽之手。燕北飞伤痛之下，故意让楚莽重伤自己，随即斩下楚莽头颅，然后跟随妻子而去。

秦百川匆匆赶到武家时，一家人都惨遭万鹏王的毒手，燕北飞答应为他们报仇。杨天彪之死仍是江湖的一大悬案，大家觉得高老大十分可疑。秦莫愁和小莲两情相悦，他为小莲杀了一巨商。叶翔警告秦莫愁身为刺客不能有情。

小何嫉妒秦莫愁，他夜袭伯园，被秦莫愁发现暗中阻止，小何不听劝阻被燕北飞捉住后放掉。燕北飞命秦莫愁跟踪小何查出指使人。秦莫愁答应高老大尽快刺杀燕北飞，小莲找到秦莫愁，把蝴蝶玉佩交给他。

燕北飞为武家人去讨公道，黄金鹏迫于燕北飞的凛然正气拔刀自刎，秦莫愁被燕北飞的人格魅力征服。孙剑和情人幽会遭到伏击，秦百川救走孙剑自己负伤。秦莫愁站在焚琴乐坊楼下听小莲弹琴，小莲有意将窗打开，自己却着了凉。

秦莫愁为给小莲买琴向鱼儿借钱，鱼儿身无分文去古华轩盗琴时，被人发现打得鼻青脸肿，但她还是将琴盗出。秦莫愁送琴给小莲，小莲发现她已深深爱上了秦莫愁。小莲发现秦莫愁准备刺杀父亲，她说服秦莫愁自己替他去刺杀父亲。

因为小莲的苦心，燕北飞逃脱两劫。秦莫愁决定自己刺杀却身负重伤，小莲心疼得泪如泉涌，两个人紧紧相拥，此情此景被高老大看在眼中。

高老大严厉训斥秦莫愁，一怒之下他将小莲绑架，逼秦莫愁杀燕北飞。万鹏王决定攻打燕北飞，方铁鹏在攻打前向鱼儿表达爱慕之情。鱼儿无意中将父亲要杀燕北飞的事说出，秦莫愁救了燕北飞，杀了方铁鹏。

秦莫愁的杀手身份被燕北飞识破。秦莫愁思念小莲，鱼儿把小莲带到秦莫愁的身边，生活这一个瞬间发生了变化……

小莲和鱼儿同伴秦莫愁身边的快乐并没有维系几天，秦百川出现在了小莲身边，他对小莲的爱湮没了对小莲的怨恨。秦百川无法杀小莲时，夏青来到小莲家外埋伏起来。高老大出现，他替秦莫愁受了一剑。

这一剑让高老大失去生孩子的能力，秦莫愁对老大的照顾让小莲无法接受。秦百川的爱情让小莲感到压力，为了秦莫愁的安全，小莲决定离开他，在蝶园住了下来。高老大伤愈后，秦莫愁开始寻找他一生要相守相伴的小莲……

鱼儿快乐地回到了秦莫愁身边，鱼儿经不起秦莫愁的软磨硬泡，答应替他约小莲。她找到小莲说。秦莫愁快死了，他的愿望是见你

鱼儿对秦莫愁诉说着自己对他的情思，但她知道小莲才是他所爱的人。秦莫愁在鱼儿离开的一瞬，感觉到一种内心的疼痛。

孙剑跟踪秦百川，知道秦百川的情人竟是自己的妹妹小莲，两个男人为了自己的私情彼此不再有敌意。谁知在孙剑私会情人小翠时，被叶翔杀死在小翠的家里。

为江湖从未出现过的高额赏金，叶翔再出江湖刺杀燕北飞，谁知这竟是燕北飞的一个花招，叶翔死在燕北飞手中。高老大悲痛万分，此时才知道原来自己是如此深爱着他。秦莫愁答应她一定杀了燕北飞为叶翔报仇。

秦莫愁寻找机会，趁乱杀了燕北飞。在动手之前，秦莫愁想见到小莲一面，而小莲也对鱼儿说，自己已经很久没见过秦莫愁了。

韩棠的死让燕北飞开始怀疑秦百川，而冯浩通过调查，发现林秀才是杀人凶手。冯浩追上林秀，他要杀了叛徒林秀。

林秀临死前知道这一切都是秦百川的手段。朴中鹤出卖了秦百川，燕北飞带人救出了秦百川。虽说是自己利用了冯浩重获燕北飞的信任，但是在林秀的坟前，他还是乘冯浩不备杀了他以告林秀之灵。

秦莫愁想在死之前见小莲一面，小莲乔装打扮到快活林，偷听到秦莫愁是为了替叶翔报仇，准备再次刺杀燕北飞。燕北飞以为自己已经放过秦莫愁一次，秦莫愁不可能再有异心了，他万万没有想到，秦莫愁会是叶翔的兄弟，他此次是报仇来了。

秦莫愁埋伏在花丛中，对毫无防备的燕北飞发起攻击。小莲突然出现，挡住了秦莫愁致命一击深受重伤，原来燕北飞竟是小莲的父亲。小莲求父亲放过秦莫愁，秦百川暗中看着这一切。在路上，小莲发现秦莫愁越来越不正常，他疯了。

秦莫愁失去了记忆和武功，他见小莲很饿，出去抢吃的。小莲在破庙里等不回秦莫愁，却被秦百川的人发现。高老大也来了，秦百川把小莲交给了她，高老大将小莲囚禁起来。秦莫愁被一个好心的老农收留。

小莲发现高老大也爱着秦莫愁。鱼儿救出小莲，一起去找秦莫愁，同时秦百川也在打探秦莫愁的消息。秦莫愁像谜一样消失在江湖。

鱼儿救了自称杀手的石群，他俩和小莲来到秦莫愁失踪的梅镇。恶少王孙兴见小莲漂亮上来调戏，被鱼儿赶跑。孙兴带人前来，石群击退孙兴等人。3人来到了桃花村，不远处，秦莫愁正呆呆地站在那里茫然地守望。

3个人帮秦莫愁恢复记忆无济于事。一天，石群唱起小时候高老大教的童谣，秦莫愁泪流满面恢复了记忆，他让石群回去告诉高老大秦莫愁已死。

高老大知道秦莫愁的意思，决心脱离杀手职业，远离江湖是非。秦莫愁和小莲在村子里住下来。鱼儿突然来求石群陪他去看秦莫愁，石群和鱼儿在梅镇的客栈低声说起秦莫愁与小莲的事情，旁边桌上的青衣老头正是燕北飞。

这天秦莫愁在山中砍柴，燕北飞突然现身，燕北飞希望秦莫愁回去辅佐自己被拒绝，高老大远远看着此番情景转身离去。鱼儿回到飞鹏堡就开始装病，石群假扮郎中前来。

石群装模作样给鱼儿治病，宋天鹏经不住鱼儿死缠烂打安排两人逃走。他们刚到外围就被万鹏王围住，鱼儿被抓，石群逃走。石群来到桃花村，让秦莫愁去见鱼儿一面，秦莫愁给小莲留了一封信前去。秦莫愁扮成樵夫进了飞鹏堡，秦百川随后也来求见万鹏王。

秦莫愁潜入鱼儿房间，被秦百川看到。万鹏王让秦莫愁娶鱼儿为妻被拒绝。秦百川告诉小莲秦莫愁和鱼儿好了，小莲夜探飞鹏堡被抓。万鹏王以秦莫愁的性命相逼，小莲给秦莫愁写了一封绝情信。秦莫愁与鱼儿成亲，小莲黯然离去。

秦莫愁思念小莲，鱼儿内心凄苦。秦百川将秦莫愁成亲的事告诉了燕北飞，燕北飞大骂秦莫愁为了富贵抛弃小莲，对秦莫愁痛下杀手。这时小莲出现说这不是秦莫愁的错。恼怒的万鹏王欲杀小莲，鱼儿为救助小莲掉下山崖，秦莫愁情急之下也随鱼儿落下山崖。

万鹏王万念俱灰，决意退出江湖，屠大鹏暗杀了万鹏王后嫁祸给宋天鹏，宋天鹏含冤而死。屠大鹏拆开密令发现万鹏王定下的继承人是自己。燕北飞攻战失利被屠大鹏囚禁，秦百川与屠大鹏握手言欢，原来秦百川是伯园的内奸。秦百川宣布燕北飞已死，自己接任帮主之位。

秦莫愁被名叫无尘的老僧救起，他接受无尘的劝导开始学习佛经。石群找到了他，可孟醒魂对一切都表现淡然，连小莲都没多问一句。石群离开时，秦莫愁说一切随缘自然。

一天秦莫愁对无尘说他有件事要去办，无尘将秦莫愁带入密室，原来无尘曾是江湖上赫赫有名的“七杀手”。无尘教给秦莫愁一套武功，秦莫愁向无尘辞行时，发现他已经坐化。高老大看着面前的秦莫愁，像不认识一样，秦莫愁没有打听到燕北飞的任何消息后离开了。

漕帮想与飞鹏堡合作私盐生意，但他们只相信燕北飞。秦百川从高老大那里弄来一种致人痴呆的毒药给燕北飞吃下，反应迟钝的燕北飞出现在谈判桌上，漕帮与飞鹏堡达成协议

秦莫愁为救燕北飞与屠大鹏恶斗，燕北飞突出重拳击伤屠大鹏，原来他早用内力将毒药逼出，谈判时他是假装痴呆。一黑衣人加入对屠大鹏的恶斗，原来是小莲。

秦莫愁同小莲找高老大，要她避一避秦百川，不想秦百川竟从里屋走出来，高老大冷冷地说对不起。小何突然出现开动机关，放走了秦莫愁和小莲，他被秦百川杀死。

秦莫愁和小莲逃进飞鹏堡，他在自己和鱼儿的新房里看到鱼儿坐在婚床上。秦莫愁感到深爱鱼儿的石群一定在附近，石群果然出现，鱼儿扑进他的怀里。4人决定联手找到燕北飞，消灭秦百川。

小莲因内疚，将白云从柳生一剑手中放走。柳生一剑为了逼白云出手，残杀所有和白云有关的人。而白云为了报复柳生一剑，不让其达成与燕北飞一战，一雪前耻的愿望，始终拒绝应战。但是白云内心也异常痛苦，因而求教于武当掌门苍木道长。苍木道出其痛苦的原因乃是心中有恨无爱，劝告其要万物有爱，坐忘一切。随后白云又受村民淳朴的感情所感，终于悟出仁者之剑，决心为了阻止柳生一剑的杀戮而与其一战。决战之时，虽然白云已几乎不逊于当年的燕北飞，但柳生一剑却技高一筹，将白云打伤，此时小莲终于发现自己所爱的乃是白云。柳生因失去有情剑的依托，阵脚大乱，死于白云之手。而小莲因不忠于柳生，而对其心怀愧疚，也因欺骗了白云无颜再回到白云身边，举剑自刎而死。夕阳下，白云双目含泪，弃剑而走。全剧终。