深夜寂静的恐龙博物馆，突然出现巨响，原来是来自另一个地球次元的进化恐龙--“爆龙”，现身在大都市各处，不断进行破坏。同样来自另一个次元的地球的神秘青年飞鸟为了阻止爆龙们的恶行来到地球，可惜爆龙们听不见他的声音，一直到杉下和笑里出现。飞鸟打算将变身手环交给他们，帮助他们变身拯救地球，可惜因为两人的“恐龙气力”不足无法穿上战服，而终不能如愿。究竟拥有强大的“恐龙气力”的战士到底在哪？

暴连者和黑暗骑士大战，以为胜利在握，谁知突然出现一个巨大的黑影，飞鸟只好舍身再战。这支刚刚诞生的爆龙战队刚组队完成马上就面临了新的危机，那就是暴蓝三条幸人决定离去，众人怎么都劝服不了他。少了一名暴连者，邪命使徒的攻击又开始了，剩下两个暴连者到底要如何应战呢？

爆龙战士们为了全力对付入侵地球的“邪命使徒”，全都搬到了“恐龙屋”。搬完家大家才发现凌驾带了个小女孩，到底这个小女孩是谁呢？凌驾来不及向大家解释，便匆匆忙忙带着小女孩到幼儿园去了。到了幼儿园，偏偏又接到通知，敌人再度出现，凌驾只好丢下孩子匆匆离去。

“恐龙屋”重新开张了，大家开始在里面打工。兰琉意外之下认识一名被同伴欺负的小学生，鼓励他勇敢面对困难，但这名小学生却做不到。此时，邪命使徒再度发动攻击，兰琉被迫独力对抗邪恶势力，千钧一发之际她要这名小学生帮她回恐龙屋找同伴相助。结果小学生办到了，也因此重拾信心。

幸人的老病人沙也加突然出现，原来一年前幸人曾经帮她治好瘫痪，不过现在又不能走了。幸人看出沙也加的问题出在心病，对赛车出事的恐惧造成她双腿瘫痪，于是巧施妙计让沙也加驾驶赛车，果然治好她的心病，沙也加又能重回F4比赛。

邪命使徒连续出动怪物进攻地球均告失败，这次他们决定派出吸尘石榴驴，吸尘石榴驴在地球上吸走偶像歌手莉莉安的青春，觉得非常有趣，因而转移目标不攻打敌人，改而不断找年轻女性下手，吸光她们的青春来增加力量，最后终靠暴连者携手，打倒这只怪物。

飞鸟从甲胄战士手中抢到恐龙蛋，日夜不停的照顾它，一直到孵出一只锤头龙为止。笑里给这只可爱的锤头龙取了名字叫“小锤锤”，而飞鸟也藉恐龙蛋孵化之后留下的营养器，得到变身能力，化身为暴黑战士，和大家一起对抗邪恶势力。

飞鸟天天都为无法替玛赫洛报仇愁眉不展，任凭贞德出动巨行使徒在地球肆虐，也束手无策，对抗邪恶势力的工作完全丢给其它三个爆龙战士。直到腕龙看不下去，给他当头棒喝，飞鸟才如梦初醒，决定暂时忘掉玛赫洛的仇，全力讨伐巨行使徒，就在这个时候，暴黑战士果然变身成功了。

凌驾正在练习攀岩时，和一名正打算跳楼的男子一起被三合使徒震到异次元世界，发现有很多地球人也都被困在那里。凌驾说服大家拿出与生俱来的恐龙精神，团结一致，一起对抗敌人，果然异次元世界的巨石破裂了，大家又重回人类世界。

美国职棒联盟全垒打王班斯突然出现，要幸人帮他疗伤，偏偏三合使徒出来捣乱，很多地球人被它变成香菇头，连班斯也不例外。一旦变成香菇头，就会利益熏心，任何事都想用钱来解决。班斯不断以重利引诱幸人跟他返回大联盟，幸亏幸人定力够，最后总算破了三合使徒的魔咒。

超能力补习班大量出现，笑里的好友若菜为了提高学习效率也加入这个补习班，跟全国数十万人一起被三合使徒控制，幸亏被暴连者识破，大家合力击退三合使徒，帮助所有学员恢复正常，从此若菜也建立了正确的价值观，不再把好成绩当成是第一要务。

飞鸟感应到又有新的爆龙出现，位置就在西边，于是大伙赶到京都，新的爆龙异齿龙果然出现了，不过这只异齿龙却受到贞德的控制，到处制造动乱。几位暴连者中了巨型使徒“时钟”的法术，跌进300年前的江户时期，回不了现代，而且还在那个时代碰上……

凌驾等三人被渥法的巨型使徒第三号“时钟”送到了三百年前的江户时代去，他们被迫只好留在那里。幸亏莉婕发现如果继续让他们留在三百年前，历史将会改写，艾瓦瑞安也会被歼灭，于是派出三合使徒回到过去消灭他们，结果三合使徒无法完成任务，凌驾等人终得以重返现代。

兰琉找到一张藏宝图，跟着图上的指示，一直找到龙之介幼时朋友传次郎的家，原来传次郎也是恐龙爱好者，多年来一直想挖掘恐龙化石。偏偏传次郎想挖掘的恐龙化石，受到艾瓦瑞安的控制，到处肆虐，最后总算靠三位暴连者的力量，将它制服。

艾瓦瑞安派出新的三合使徒，专门针对暴连者内心深处的弱点加以打击，幸人跟他爸爸一向关系不好，便成为它们攻击的目标。幸人爸爸变成魔鬼，经常在幸人面前出现，使幸人失去理智，到处逞凶，发现新爆龙蛋的小朋友因此成为受害者，在医院中昏迷不醒。

飞鸟因为寻找爆龙蛋不顺利，陷入忧郁中，龙之介想用传统卡波里舞为他解忧，结果却使飞鸟陷入更严重的忧郁。和平的日子很短暂，一名奇怪的白衣男子出现了，他向大家宣示他才是真正的对手，剑龙也提醒大家和平的日子不再，到底暴连者们将会面临什么样的困难呢？

三合使徒又出现了，就再这只山茶电话鳄准备作乱石，出现了一个身穿暴战服的战士，马上就把三合使徒解决掉，这名战士自称暴杀手，并且向几名暴连者挑战，面对这样的对手，大家一时之间也搞不清他到底是敌是友。

飞鸟警告大家他感受到史上最恶的杜毕翼龙即将诞生，这只爆龙王将会毁掉地球上的一切，要大家一起阻止它的诞生。只可惜爆杀手百般维护，几名爆连战士根本不是他的对手，加上贞德从旁阻挠飞鸟，希望坐收渔人之利，最后这只杜毕翼龙果然诞生了，一出生就流露邪恶气息，和爆杀手沆瀣一气，爆连战士们个个如临大敌。

爆杀手轻而易举就收服了充满企图心的剑龙，加上新生的杜毕翼龙，以2比7的实力向爆连战士发下战书，誓言要赢得比对手更多的爆龙回来。强敌当前，幸人对剑龙好言相劝，希望他重新归队，但剑龙不听，一心想证实自己到底有多大威力，危机当前，大战一触即发，爆连战士要怎么化解呢？

三合使徒椰电话鳄鱼怪卷土重来，被爆杀手收服，成了他的佣人。鳄鱼怪爱上了一天到晚咒骂它的兰琉，天天缠着她，并向她求婚，害兰琉被伙伴们取笑。另一只爆龙─甲龙出现了，不过这支爆龙懒惰成性，不肯接受指挥，经飞鸟一阵训斥，终于肯支援爆连王，和爆连战士们合力击退爆杀手。

仲代壬琴还在继续他的游戏。这次他掳走锤头龙跟异齿龙，把它们绑在树海里，然后通知爆连战队，三天之后要是爆连战队还没抓到他向艾瓦瑞安订制的三合使徒，锤头龙它们就会身手异处。爆连战士们想尽办法寻找这个三合使徒，最后被他们找到了，也解决了这个三合使徒，谁知爆杀手却说那是假的。

爆龙战队仍加紧寻找电波怪的下落，电波怪继续透过电波，把分身传给观众，让他们恣意横行。炸弹引爆的时间越来越近，锤头龙开始失去信心，爆杀手趁此机会将催眠电波传给它们，等爆连战队消灭电波怪赶到，他们已经完全被爆杀手控制住，爆杀手甚至带着这两只爆龙扬长而去。

米开朗跟渥法制造出来的怪兽，一直对付不了暴连者，莉婕一气之下，下令它们到人类世界好好观摩观摩。米开朗一到地球，见猎心喜，搜集了好多东西，甚至把幸人之外的暴连者也都收进它的图鉴里。为了营救伙伴们，幸人不惜扮成高中女生，果然圆满达成任务，不过留下的照片却成为伙伴们的笑柄。

绘马苍蝇松出现在地球上，任何人只要在苍蝇松提供的开运牌写上愿望，苍蝇松就会让他梦想成真，万一愿望无法实现，而感到悲伤时，绘马苍蝇松的功力便会不断增强。这只怪物藉此办法控制了凌驾的朋友明男，打算炸掉明男的学校，帮他为运动会无法实现的梦想出一口气，幸亏最后被凌驾等人制服了。

大家正在收看凌驾和小舞最喜欢的卡通“钓鱼痴日记”时，三合使徒突然从电视里抓走钓鱼痴阿滨先生的宝贝儿子鲤太郎，阿滨先生大惊失色，拜托凌驾帮他把儿子找回来，为了和大家一起对付三合使徒，还从电视里跳了出来，和大家并肩作战，终于完成这项不可能的任务。

章鱼怪三合使徒将凌驾和幸人身份对调过来，得到莉婕的赞许，于是重回地球，打算将地球人身份来个乱掉，颠覆这个星球。凌驾和幸人一方面要解决自己身份被对调的问题，一方面得设法阻止三合使徒的诡计，就连前来支援的霸王龙和三觭龙身份也被对调了，搞得大家手忙脚乱。

米开朗得知德志魔宙斯肉体即将毁灭，为了邀功，派出处方凤仙变色龙到人类世界物色新娘，想让她们怀下邪命神的后代，出生之后将新生肉体献给德志魔宙斯。为了抓到这个神出鬼没的三合使徒，兰琉和笑里不惜亲自扮新娘，最后终解决掉处方凤仙变色龙。就在此时，莉婕不甘寂寞也来到壬琴家中，自愿和他携手合作。

米开朗派出新的三合使徒到地球寻找莉婕，这只新怪物具有复制能力，能复制出对手的武器，搞得暴连者们无计可施。此时，战士们发现壬琴整天陪着来自恐龙世界的莉婕玩乐，不知道壬琴到底是何居心，壬琴为了阻止三合使徒带走莉婕，故意协助暴连者们将它击败，莉婕为了感谢他的相陪，决定带他前往恐龙世界。

壬琴随着莉婕回到恐龙世界之后，立刻下手干掉米开朗精心制作的复活三使徒，据地为王，要大家都臣服于他。隶属于壬琴的杀手亡魂问世了，壬琴打算拿暴连者来试刀，故意放出风声，让暴连者知道锤头龙它们的位置，引他们前来，要他们以锤头龙和异齿龙做为赌注，和杀手亡魂一决胜负。

暴杀手精心打造的致命武器“杀手亡魂”终于完成，他以几只爆龙做为诱饵，逼暴连者跟鬼杀手一决胜负，飞鸟的最新武器尚未完成，凌驾他们被迫硬着头皮上阵，结果都被打落海里，此时飞鸟带着最强的武器要他们将大家的爆龙力量集中起来，全力抗敌，一股前所未见的神奇力量果然出现了。

正当暴连者们沉浸在打败黄金杀手的喜悦中，阿诺玛洛嘉里斯又卷土重来，以更先进的装备，在贞德指挥下，大举杀到。另一方面，飞鸟从香澄和腕龙口中得知自己背叛族人的过去，为了赎罪，打算摧毁传说中的铠甲，和贞德同归于尽。

飞鸟跟贞德在大爆炸中丧生，大家正在疗伤止痛，壬琴又发动巨型使徒龙胆琉璃蛭，到处劫掠运动员精神，连暴连者们的爆龙力量也被它给抢走。此时，飞鸟的口琴出现了，给了大家很大的鼓励，大家一鼓作气终于干掉龙胆琉璃蛭，抢回飞鸟留下的口琴。

真幌出现了，但她已完全失去记忆，只好暂时留在恐龙屋休养。另一方面，壬琴无聊之余，令渥法做出超厉害的巨型使徒，控制木星，打算让它撞击地球，毁灭一切。为了拯救地球，凌驾终于下定决心，与壬琴一胜负，最后壬琴果然被他打败，不过凌驾却不忍心杀他。

德志魔宙斯为了复活，要三合使徒帮它到地球寻找恶魔石，结果却碰到兰琉等人到展览会场观赏飞鸟制作的手镯艺术品。怪物抢走恶魔石跟手镯，兰琉数度变身想抢回这两样东西，最后终于在疑似暴黑的战士相助下，顺利完成任务。这个神秘人，真的是飞鸟吗？

三觭龙和同伴谈心时，说出自己很想变成人类到处看看，没想到一觉醒来，真的变成人类的小朋友。此时，渥法出动巨型使徒“奇迹”，到地球上进行破坏，让有梦的人个个都能实现梦想，沉醉在梦境里，幸人和变成小孩的三觭龙，无意间上了“奇迹”肆虐的一艘游艇，三觭龙被绑，幸人奋不顾身救他，最后三觭龙心满意足回复他的爆龙身份。

莉婕经过快速成长，终于成为成熟的美女莉珠儿，为了打造最好的宝石，不惜带着巨型使徒来到地球，离间亲子感情，引诱父母离家出走，然后收集孩子们的眼泪，用它凝聚成宝石。面对杀人不见血的劲敌，爆龙们决定团结起来，合体成为极限龙王，终于击败巨型使徒，使很多家庭重新团聚。不过壬琴和莉珠儿并不死心，他们发誓会卷土重来。

莉珠儿妄想以新开发成功的口红怪三合使徒，消灭地球上所有的女人，以免壬琴移情别恋。偏偏笑里为了不想跟爸妈举家迁往泰国，决定变身成暴粉红，和暴连者一起对抗怪物，让爸妈见识一下她的本事。这次，口红怪相中了笑里，当着她爸妈的面将笑里变成一朵花，令笑里的爸妈大惊失色。

笑里被口红怪变成一朵花，笑里爸爸气得暴跳如雷，一定要爆龙战队负责把女儿救回来。凌驾在几只爆龙的支持下，变身为极限龙王，发挥无限的威力，终于击败口红怪，让莉珠儿知难而退，笑里和其它被变成花的女性也都回来了，笑里父母心甘情愿让她留在恐龙屋，这场风波总算圆满结束。

真幌独自前往战场寻找飞鸟，两人交手时，刺盾角龙给了她启示，真幌终于知道救飞鸟唯一的办法，便是当正邪两股力量合而为一时，举剑砍死飞鸟，她决定牺牲自己救回飞鸟。于是她主动去找壬琴，愿意回复贞德的身份，协助壬琴夺得黑暗铠甲。最后计划成功了，不过飞鸟却透过两人脸上的爪印，得到真幌自我牺牲的讯息，当即悲痛莫名。

莉珠儿又派出新的三合使徒“耶诞驯鹿麻”到地球上送圣诞礼物，所有收到礼物的人全都被变成巴米亚士兵，连小舞的同学也不能幸免。幸亏飞鸟想出以爆龙力量退敌的办法，于是呼唤大家拿出内心深处的爆龙力量对抗敌人，终于战胜圣诞驯鹿麻，重新变回人类。

米开朗跟渥法发现德志魔宙斯就寄宿在壬琴身上，一心想帮德志魔宙斯复活，顺便干掉壬琴，于是主动献计，提供壬琴最新的巨型使徒“不灭”，壬琴兴冲冲领着不灭跟暴连者对决，没想到不灭临阵倒戈，壬琴受伤惨重，而贞德跟米开朗等人则在一旁坐收渔人之利。

渥法和米开朗用计，让巨型使徒“不灭”在战斗中吸收杀手，困住他，使附在他身上的德志魔宙斯得以复活，一切安排得天衣无缝。偏偏暴连者识破他们的诡计，莉珠儿也不忍爱人为恶魔控制，于是最后一刻，杀手终于在千呼万唤中摆脱德志魔宙斯的控制，大家以为他从此会弃暗投明，谁知杀手却说自己另有打算。

几个同一公司的职员，天天都做同样的梦，原本只是平凡上班族的他们，在梦里化身为暴连者，对抗侵略地球的邪恶组织。另一方面，凌驾等四个人却一直在恐龙屋沉睡不醒，到底上班族是梦？或者暴连者才是梦呢？同时，被兰琉等人俘虏的鳄鱼怪也做了一个梦，梦见自己用法术把暴连者关进梦境里去了，正沾沾自喜向米开朗邀功，鳄鱼怪真的是做梦吗？

米开朗为了庆祝德治魔宙斯复活，特地做了恭贺用的三合使徒“七草伦巴猴”，利用过年期间，到地球上大跳伦巴舞，使许多人像着了魔一样，整天跳个不停。幸亏这个三合使徒主动透露他用来控制人类的光束，材料来自过年吃的七草粥，于是兰琉心生一计，煮了七草粥给大家吃，总算成功赶跑伦巴怪。

德志魔宙斯复活了！他利用专门在电视上帮人祈福改运的出云兰，假借祈福之名，教他们念咒，然后让他们的灵魂沉入浓雾笼罩的湖底，培养自己的肉体，陆续有一百万人受害，而他也马上就要修道成功。幸亏幸人他们看穿出云兰的诡计，和壬琴一起携手，打败出云兰，坏了德志魔宙斯的复活大计，不过德志魔却说他还有最后一个绝招。

德志魔宙斯终于复活了，贞德传来讯息，指出只有五名战士力量合而为一，才有机会战胜它。于是壬琴在凌驾殷殷要求之下，终于决定加入。果然，五人的力量合一时，神奇的光出现了，德志魔宙斯也被击退，不过它却控制了贞德的身体，打算藉渥法和米开朗的力量，进行最后一搏。

德志魔宙斯一心要报复暴连者，毁灭人类，它附在米开朗和渥法身上，向暴连者开战。大家用尽了办法都赢不了它，最后壬琴决定和德志魔宙斯一决胜负。壬琴在伙伴们的爆龙力量支持下，力拼德志魔，最后因为附在壬琴体内，另一个德志魔宙斯的力量消失而身亡，给大家留下无限的哀思。

德志魔宙斯形体终于死亡，但它的怨念并未消失，它继续酝酿更大的风暴，打算掀起“黑暗的两百日”，让地球毁灭。真幌打算跟德志魔同归于尽，这时候飞鸟向她奔去，打算和真幌同生共死。最后一刻，兰琉赶到，提醒飞鸟小宝宝正是他的亲骨肉，要飞鸟善尽做父亲的责任，飞鸟终于决定努力活下去，和大家一起对抗顽敌。

凌驾和幸人力战德志魔的最后一刻，德志魔终于被炸死了，但凌驾和幸人也失了踪，留下还在等待叔叔回家的小舞。经过半年，真相终于揭晓，原来最危急的一刹那，幸人要凌驾放弃搏斗，随他潜入地心，终于逃过大难。完成任务之后，凌驾便带着小舞环游世界，兰琉继续回到赛车场，笑里则跟着幸人四处为人治疗，一直到半年后，一次同乐会中凌驾.幸人.兰琉三人再次在恐龙屋相聚，同时离开的阿斯卡和真幌也i“回来了”，暴杀手也和内人一起回归，大团圆结局。