小女孩四季问她的爸爸，为什么人类历史上会有这么过苦难和杀戮。她的爸爸也就是未来的王大锁告诉自己的女儿，这都是历史的进程。那么历史的进程和拯救明天是什么关系呢？原来，二战时期的大屠杀与一件黑科技有关——灵魂分割术，这项科技可以将明天和缇先生的灵魂进行彻底分离。

南烛带众人找到了记忆中的杂货铺，杂货铺老板已认不出这个消失了二十年的男生，老板提供了线索，众人找到了南烛的老家，柳心为南烛租下了以前的家，终于找到了藏在地板下的机关。

南烛年少时迷恋上了被家暴的女老师，他深陷于师生恋中，并用实验分割老师的灵魂，由于他执意收集老师的灵魂，灵魂宿主受到了伤害，南烛遭到了指责。

南烛将女尸藏于冰柜之中，多年之后女尸腐蚀。空渊找来了老师的肉体，南烛因此成功令老师复活。由于南烛认为老师没有了忠贞，他大发雷霆将老师囚禁了起来。

老师离开了，南烛对外面的世界已无留念。他决定再次回到意识监狱，过回以前的生活。而明天与0.01盎司的缇先生完全融合，这一次是明天吞噬了缇先生的灵魂。就在大家为明天担心纠结时，明天似乎很释然，与缇先生一起玩游戏、一起聊天。

华森告诉明天，他们都是复制人，在五岁的时候通过人贩子被卖到了全国各地。而明天五岁时曾遭遇车祸，明天的父亲当时建立了一座实验室，华森推断他们都来自那座实验室，而且除了明天，其他的复制人都有缺陷，因此是明天的父亲克隆了他们，这一切都是为了拯救濒死的明天。

在宾馆，联盟实施了再次抓捕，李国栋在柳心眼皮底下被联盟带走。但柳心追出去的时候，又碰见了淡定自如的华森，这使得柳心很疑惑。联盟带走的李国栋突然死亡，未来的王大锁发现他有心脏病，不是真正的明天。明天的复刻版李大柱被缇先生催眠，解开了明天的铁链，明天成功逃出了华森的掌控。

未来人现身欲杀明天，柳心为救男友失去执念力。明天惊闻自己身世，未来人告知明天，其实他也是复制人。明天一时无法接受这样的事实。未来人在医院找到了复制人的本体，那是一个在病床躺了多年的植物人。

警察局里的神秘档案记录了实验室无端起火一案，明天的父亲正是在这起案件中遇难的，警方发现了实验室曾进行过许多非法研究，但令人奇怪的是，警方再去调查时，实验室竟然消失了。警方还发现实验室有一项关于放大人体电磁能量控制电器设备的研究，因而推断电梯坠毁案与明天有关，还邀请明天参与对电梯坠毁案的调查。

明天等人开始寻找戴超，而戴超答应柳心五天之后一定放她回去。戴超母亲突发心脏病，柳心和戴超一起将她送到了医院。戴超向柳心讲述了自己的经历。白部在电视中看到电梯事件后，他又找到了戴超。明天等人进行了细密的调查，他们怀疑当年明年的去世是一场事故，而真正的凶手就是明年的助理白部。

为了查明真相，明天等人带白部和戴超进入了消失已久的实验室。在那里，白部坦承了自己害死明年的真相，他还想通过相同的办法害死明天。但因事情败露，白部被大锁关进意识监狱。

失去执念力的柳心很是失落，分别向汝烟惜、空渊询问如何恢复。贾缪在商场前救了陈柏林，意外结识柳心，明天心有不悦。

网吧中贾缪与柳心再次碰面，柳心用自己身份证给贾缪开房，明天误会，将贾缪带回警局调查，发现贾身份可疑。未来联盟发现陈柏林被救是历史发展错误，及时修复。

为了躲避联盟的追逐，贾缪带柳心穿行到平行世界1的女权世界。柳心见识到了女权世界的种种不可思议的现象，遇到陈胜。

贾缪回到他的世界，发现战争已经毁坏了家园，杀死了他的爱人。在愤怒之下贾缪毁坏了穿越时空的箱子，留在已为废墟的家园只身抵抗战争。

警察在郊外的大桥下发现了一具流浪汉尸体，经调查流浪汉是海归IT精英李知凡。案件还未水落石出时，又有人报了案，一名叫肖一枫的大学生请求调查他的同学洪蕊，说洪蕊曾经是风靡一时的校花翻译，但现在很反常、很颓废，还有可能吸毒。可警方通过检验发现洪蕊并未吸毒。

明天找到李知凡的同事，同事表示李知凡生前没有不良嗜好，在他离职后，同事去家里找他，李知凡称自己迷上了真人搏击，令人感到诧异。明天又找到洪蕊的同学，得知洪蕊在离开学校之前表现十分奇怪，她说自己要去修仙。明天就此继续展开调查。

明天调查李知凡、洪蕊时，却发现肖一枫也遭遇了同样的异常状态。为了查明真相，他带回可疑物证——项链和眼镜。当明天带上复古眼镜进入昏睡状态，意识中却意外的体验了李知凡游戏般的离奇经历。幸好，缇先生及时帮助他从梦中醒来。

众人为了探究朱邪窃取时间的动机，纷纷进入朱邪设计的意识游戏中寻找真相，了解到朱邪本无意害人。朱邪总共卖出67件饰品，明天表示必须将这些饰品全部收回，避免更多的人沉迷其中。后来朱邪身亡，67件饰品也被收回，柳心说要将这些饰品藏到没有人可以找到的地方。

执念师米德在执行任务时因车祸与联盟失去联系。联盟多次搜寻无果后，议会决议放弃搜救米德。未来王大锁决定以个人身份继续寻找米德。与此同时，现代社会的曲小弯和柳心在一次驾车外出时，撞上了意识恍惚的米德。经医院检查，米德已经神志不清，意识全无。

米德和未来王大锁执行任务时失误，在危急时刻，空渊救了未来王大锁。回到联盟后，议长麦利亚斯要追责惩罚二人，被恒者从轻发落。知者健康堪忧，欲启动天演计划，即将知者身体机器化，未来大锁执意反对。

空渊因为多次穿行时空遭到议会审判，但他声称这一切都是受到知者授权的，他要求与知者当面对质此事。联盟议长麦利亚斯、未来王大锁和米德三人带空渊见知者，却不料知者被空渊行刺受伤。知者伤势严重，必须进行天演计划，身体与机器融合才能继续保持生命与运算。

空渊称联盟是个骗局，让四人去见识联盟真实的世界。四人进入米德意识见识到真实的未来世界荒芜一片。空渊揭示了联盟的虚无和欺骗，四人失望焦虑，陷入沉思。未来王大锁来到现实世界搜寻米德无果。米德被曲柳如烟惜送入疗养院。

曲小弯和柳心在论坛上发现一个求助帖，求助人声称被联盟追杀，寻求帮助。为查明真相，两人将此人约出来，发现发帖者居然是知名女作家金茶。金茶说曾经在工作失意时遇到一位神秘人，神秘人承诺以十年后收回她性命为交换让她功成名就。

金茶向柳心和曲小弯求助。随后金茶在曲柳二人帮助下逃过质子伪装的服务生刺杀。回到家中，质子伪装成金茶闺蜜再度行刺，被戴超及时阻止，质子逃脱。随后质子又先后伪装成保安、交警、大妈行刺。未来曲柳锁发现麦利亚斯擅自派出执念师质子，决定粉粹麦利亚斯的阴谋。

大锁忙活了半天，却只做出了一碗沙拉，遭到汝嫣惜笑话，但大锁表示自己为了汝嫣惜什么都愿意做。两人情到浓时正准备接吻，柳心的一通电话扰乱了两人的甜蜜时刻。作为意识之王的大锁，也遇到了进不到意识中去的情况。

金茶的意外死亡使大批粉丝一时无法接受，而她留下的最后一部作品也得到大家的认可。大锁上门表白汝嫣惜，却意外遭到拒绝。未来大锁找到柳心和曲小弯，劝她们离开时空裂缝。

柳心和曲小弯跟踪明天的路上遇到了被黑社会追债的高丽莎，黑社会对她痛下杀手。高丽莎有“灵魂互换”的执念力，在关键时刻将自己和曲小弯互换了灵魂。汝烟惜迅速衰老，王大锁送其去医院，感到心痛不已。

曲小弯过上了之前高丽莎痛苦的生活。大锁进入了汝嫣惜的意识中与她重逢。如果在汝嫣惜死去之前大锁不能从意识中出来，他就会永远被困在意识中永不翻身。

汝烟惜临死之际，逼大锁离开。汝烟惜死后，王大锁沉浸在痛苦之中不能自拔。柳心明天发现了“曲小弯”越发反常。空渊向曲小弯讲述了灵魂交换的原委，给予启示。

与高丽莎互换灵魂的曲小弯被庄强下药签了借款欠条，因为还不上钱被黑社会绑架。曲小弯借机挣脱绳子逃跑并报警，刚好接到出警任务的是明天，三人赶到现场，危机迫在眉睫，历史又将重演。

一场未遂车祸引出神秘女子孟婵，勾起王大锁等人怀疑。众人跟踪孟婵发现其执念师身份。孟婵欲离开联盟，做一个普通人。王大锁为送孟婵被误解成流氓，引出多位执念师与之交手。

执念师组团入住执念大院，众人执念力遭遇结界难以施展。执念大院惊现肇事车辆，为破案王大锁决意主动接近孟婵深入因果街调查。王大锁欲走出失恋阴影爱上未来女下属孟婵。众人为查案想入住因果街遭孟婵奶奶强烈反对。

詹詹告诉众人大院里面居住着的执念师的执念力等级，有隔空移物能力的康叔引起大家的注意。同时明天带来了事发地点的照片，照片中人就是康叔，大锁也回想起康叔一直跟着自己。同时孟婵也出现在照片里，引起大家怀疑。

明天在所长的房间里发现标有因果街众人名字的磁带，可是却独独没有王大锁的磁带盒，大锁推断只有听完一整首才会受控制。另一边柳心和曲小弯被所长困在了幼儿园，并把她们缩小。

孟婵这次的情况和以往不同，总感觉大家被人暗中盯着，感觉之所以会被联盟发觉因果街和曲小弯等人有一定关系。明天因为卧底不顺利，被局长批评。回到家中被柳心读出心中所想，柳心和曲小弯提议帮助明天去Du场卧底。

王大锁穿越成为苏武，研究公羊下崽儿。柳心穿越杨玉环，面对安禄山清君侧。曲小弯穿越成为农妇，被男人蹂躏。曲小弯悲痛服盐自尽。

空渊回到联盟，救出曲柳锁三人后，公布自己的真实身份——恒者。他告诉三人，在得知联盟只能救五分之一的人时，便开始打算创建另一个组织去推翻联盟，从而创造一个更加美好的光明未来。

空渊把2016年他所在的坐标定位罗盘留给了知者，吩咐将其一代代传下去，让第二个光明未来的使者带着罗盘去2016年找他。空渊回到2016年后，如愿以偿地见到了那个来自未来的使者——明天。