为救治被病痛折磨的妹妹张樱，店小二张谊欲混入太乙书院寻医治百病的秘方。张谊应聘成高丽公主王恩珠的脚夫一同前往太乙书院，谁知书院主事武陵先生拒绝学生带陪读，他只得偷南唐太子李璟玉的荐书混入书院。

门阀之女崔伽罗因拒绝婚事被父亲安排到书院修身养性，墨家传人端木正带着一腔热血到书院学习。书院发生黄金失窃案，张谊深陷牢狱之灾。王恩珠不相信张谊是盗贼，她联手李璟玉等人一起解救张谊。

王恩珠等人赶至法场将被执行死刑的张谊救下，继而张谊根据众人描述还原黄金失窃案整个过程，他们最终将假扮成刘沫的罪犯绳之以法。为表破黄金失窃案的谢意，学院孟山长特批张家兄妹入读太乙书院。

书院学生郑祖耀爬山丧命，一系列奇怪的事令张谊等人推断出郑耀祖的死不是自杀。李璟玉的一首词引发张谊的好奇心，继而推断出从郑耀祖处买词的人是凶手。

张谊和李璟玉等人夜访古玩店寻找郑耀祖遇害线索，此刻店主暴露本性要灭口众人。在逃离途中，端木正被蒙面人用暗器所伤。张谊和李璟玉设计抓蒙面人，问话时蒙面人服毒自尽。

青眼兽越狱后目标是太乙书院，整个书院处于惶惶不安中。青眼兽拉拢张谊为己所用，但张谊不为所动，原来两人曾是同门师兄弟关系。在张谊的运筹帷幄之下，青眼兽落网书院恢复平静。

书院组织学子去府学参观稀世珍宝晋氏璧，李璟玉却发现晋氏璧是个赝品。晋氏璧本是崔伽罗母亲的遗物，也是她和李璟玉的定情信物，此时却成了她同父异母妹妹的嫁妆。学官带着晋氏璧逃走，张谊等人设局巧妙夺宝，随后晋氏璧物归原主重回崔伽罗的手中。

周府的家丁被毒杀，张樱验尸时不小心中毒。张樱没有解药有生命危险，端木正和李璟玉为救朋友说出属于他们的秘密。

校尉确定凶手是独眼狼，十年前独眼狼因为售卖假的王羲之字帖，动武谋杀当年的校尉大人。如今周大人委托柳老爷拍卖王羲之的字帖真迹，随后柳老爷被独眼狼绑架。

独眼狼在拍卖现场诱使柳老爷说出真相，原来十年前柳老爷为夺取独眼狼的王羲之真迹，谋杀校尉嫁祸给独眼狼。十年前的冤案澄清，张樱也解毒转危为安。学院的女学生孙清清跳楼自杀，夫子发现她被人玷污并未婚先孕。

李璟玉谣传孙清清已经提供破案线索，当晚幕后真凶想要杀孙清清灭口，却被埋伏已久的张谊等人当场擒获。幕后真凶落网招供，他的目的是摧毁孙清清的婚事。

校尉收到恐吓信，随后他的儿子患上怪病。原来五年前城里发生瘟疫，校尉为了封锁疫区屠杀病人，病人的亲属为了复仇遂毒害校尉的儿子。李璟玉男扮女装溜进太守府，查出瘟疫患者的名单，真凶的身份终于浮出水面。

凶手谋杀校尉受阻，凶手身绑毒药誓要与校尉同归于尽，端木正出手解除危机。崔伽罗算卦得到大凶之兆，张谊不肯听劝带着大家去了红绡歌舞坊。歌舞坊的一间雅间每晚会少赚五两银子，张谊发现问题和暖炉有关，伙计因此被辞退。

匪徒打劫歌舞坊，张谊的客房却被搜出很多银两。张谊被捕在牢房遇到伙计，他偶然得知歌舞坊有密道。张谊越狱查出劫匪凭空消失的办法，崔伽罗和张樱却遇到危险。

歌舞坊的红姨制造劫案是为绑架崔伽罗，目的是协助主公操控崔家夺取天下，幸好李璟玉等人设伏救出崔伽罗。江北爆发蝗灾，书院要求学子为赈灾献计献策。张谊利用众位夫子的墨宝，举办拍卖会筹款赈灾，最终用善款为灾民买粮施粥。

学院通过考试选拔十个国子生名额，王恩珠目不识丁却考了第一名，学子们认为书院作弊聚众打架。王恩珠状告主考官舞弊，然而唯一的证据考卷已被烧毁。

王恩珠败诉被罚杖责，文素先生拿出铁券为她免除责罚。主考官为医治母亲家境清贫，他向母亲承诺没有舞弊。管家曾辅助主考官阅卷，张谊揭穿有人调换考卷趁机舞弊。维修城墙的银两亏空三千两，孙管库购房买地刚好花费三千两，校尉刑讯逼孙管库招供。

孙妻上吊自杀留下一个冤字，孙妻的姐姐击鼓鸣冤自曝三千两是她的嫁妆。张谊一行受命调查，却发现孙妻是被人谋杀……

证据显示孙管库才是贪污案真凶，张谊一行开始调查孙妻遇害案。崔伽罗假扮孙妻的冤魂，诱逼孙妻的姐姐承认和妹夫出轨，孙妻之死的真相终于水落石出。

张谊坦白破案的关键，正是孙妻姐姐用的胭脂。前朝七皇子逛青楼，却被人残忍杀害，康城公主施压要求校尉尽快查出杀害弟弟的真凶。张谊一行认为凶手肯定和七皇子有仇，他们查出七皇子烧毁客栈害死过很多人。

青楼的厨子自首承认杀害七皇子，他亲眼看到七皇子的手下烧毁客栈，他为帮乔家夫妇复仇杀人。张谊放出斩杀厨子的消息，引诱厨子说出为儿子小刀顶罪入狱的真相，康城公主强行带走杀害弟弟的凶手小刀。厨子十六年前受托带着康城公主的儿子出宫逃亡，小刀竟是康城公主的儿子。几名乞丐突然七窍流血而亡，同时张樱的有毒药材浮戎花失窃，张谊查出是谢婉儿盗走浮戎花。

端木正等人用谢婉儿的名义，约出嫌疑人杨师兄和韩师兄。端木正趁机暗查韩师兄的宿舍，根据线索找到浮戎花。韩师兄绑架张樱勒索毒花，他坦白制毒的野心。端木正赎人却被打晕，他苏醒后却和张樱身陷火海。张樱二人逃走后又被追杀，危急时刻张谊等人赶来救援。武备库安放重要武备，岂料武备仍旧失窃。有人匿名举报端木正和武备失窃有关，案发现场又发现端木正的学院腰牌……

盗贼挖地道从武备库盗走武备，张谊等人一路追查，发现粮店、糕点铺子、府学都有疑点。有人假冒府学学生运送兵器出城，端木正和李璟玉拦截夺回一批兵器。糕点铺子被火焚毁，却留下残破的武备。校尉谎称结案又运来一批武备，当晚盗贼再次盗窃，却被张谊带人当场抓获。南唐二皇子造访书院，他偷走兄长李璟玉的荷包。江南江北两国谈判，二皇子却在宴会上中毒。

李璟玉认为北朝的梁尚书不是凶手，二皇子的生死影响着南朝和北朝的和平。二皇子病情加重，恩珠和李璟玉进山帮他采摘解毒的蘑菇。校尉从鸽子身上截获密报，随后李璟玉遭人暗杀。真凶再次试图毒害二皇子，张谊揭穿他此举的阴险目的。李璟玉突然失踪，他的床上满是鲜血，李璟玉留下的线索直指青云客栈。李璟玉在客栈装神弄鬼，张谊爆料土村村长的儿媳妇小小诈尸的奇闻。

村民爆料小小的棺材里出现一个人偶，原来小小就是被丈夫刘毅家暴致死。张谊等人调查人偶的来历，苗女揭穿棺材里的人偶是用来下蛊的替身偶。祭品莫名失踪，张谊当着刘毅的面揭穿小小假死。苗女下药想要谋杀张谊等人，危急时刻刘毅带人前来找小小。小小假装跳崖骗过刘毅，武备失窃的案件也终于告破。李璟玉定制衣服送给恩珠，他和成衣店老板四娘举止亲密，这可惹怒了恩珠。

四娘掌握山匪和朝廷要员往来的罪证，校尉希望张谊等人护送她去顺民府。张谊一行还没有出城就遇到山匪行刺，随后端木正独自保护四娘，张谊几人驾驶马车引开山匪。张谊疑心四娘是南唐派到江北扰乱朝纲的内J，他和李璟玉反目。山匪追着四娘的马车到了顺民府，岂料官员勾结山匪伏击四娘。张谊竟和李璟玉假装闹翻，设法将四娘送入城交给钦差。李琮接替校医工作，他和崔伽罗的关系不一般。

李琮一直拿着崔伽罗的手帕，他也一直没有成亲。学子陈明润的脸上起了痘疮，张谊推测李琮是幕后黑手，又认定李琮的目的是寻找则天宝藏。其他患病的学子逐渐康复，只有陈明润在见到张谊后急症身亡。张谊背上杀人罪名被押往官府，崔伽罗却拿出手帕，揭穿李琮杀死陈明润的阴谋。城里首富魏老爷的长孙被山匪绑架，山匪勒索巨额赎金，张谊为还魏老爷的恩情决定亲自救人。

山匪收了赎金后没有释放人质，反而进了城。山匪送来断指又勒索黄金千两，魏老爷打算卖地筹钱，张谊怀疑绑匪就是买地的乡绅。郭家和徐家买地行为可疑，李璟玉开始调查两家产业。断指的小乞丐抢走恩珠的糕点，张谊为小乞丐疗伤却发现绑架线索，小乞丐带着张谊等人找到绑匪。张谊设法卧底找到人质，他们经过一番厮杀抓捕绑匪，校尉查出绑架案的幕后黑手是契丹女子。

契丹人离奇从校尉府失踪，原来契丹人花钱收买看守逃走。举报契丹人的线人逼杀，张谊认为凶手不是契丹人。张谊怀疑凶手在追杀契丹人，他放出契丹人藏在魏府的谣言，官兵则在魏府埋伏，岂料凶手绑架恩珠要挟官府交出契丹人。张谊利用钱币找到契丹人，这才得知契丹人竟是契丹的东丹王。李璟玉等人设法救回恩珠，杀手是契丹太后的死士，杀手声称须弥府窝藏东丹王将会受到被契丹大军血洗。

契丹大军突袭须弥府，府城只剩一千守军。学子帮助校尉制定战术，张谊谋划意图将契丹大军诱入埋伏圈。端木正负责在高地上用投石器进攻，恩珠则在大路上设置火药陷阱，他们却互相拿错武器。张谊潜入敌营放火，引诱敌军进入圈套，端木正的投石机却在此时损毁。契丹大军攻城，学子和守将拼死厮杀夺取战争胜利。恩珠和吴世成打猎时起争执，随后吴世成被一箭射杀，恩珠被指责是凶手。

张樱从凶器箭矢上提取线索，澄清恩珠没有杀人。高丽使者造访书院，他正是吴世成的父亲，原来恩珠已经被赐婚给吴世成。高丽使者要将恩珠押回高丽受审，李璟玉为了保护恩珠不惜挑起两国战争。三公主和吴世成有情书往来，李璟玉等人推测贞嫔为了防止王后和明嫔结盟杀害吴世成。崔伽罗施展通灵术和死者的鬼魂交流，她声称可以用油锅捞铜钱的方法辨别凶手……

几个大户人家发生失窃案，张谊觉得府城新出现的番僧十分可疑。番僧曾成功预测老乞丐的死期，更是凭借善举获得大批信众。番僧打败勒索保护费的流氓，又预言张谊的爱情注定没有结果。番僧宣称周家小少爷是灾星，他强逼小少爷出家挡灾，信众们随即包围周府闹事。原来小少爷竟是流落民间的南楚太子，番僧的主人想要利用小少爷操控南楚。番僧做法事替小少爷化解业障，小少爷却在众目睽睽之下消失。

番僧的信徒十分可疑，张谊怀疑番僧就是盗窃案的主谋。张谊揭穿小少爷就藏在番僧的佛像中，随后番僧被逮捕。恩珠总是梦到一个女人，崔伽罗施展催眠术，恩珠想起母亲被父亲毒杀的记忆。齐山长率领蓬莱书院声势浩大的拜访太乙书院，两个书院为了争夺上京朝觐的名额，举办重阳节比赛。第一场比赛蹴鞠，蓬莱书院大获全胜，端木正却在比赛中被踢伤腿。

恩珠在射箭项目上夺冠，为太乙书院扳回一局。第三局是模拟作战，太乙和蓬莱争夺藏书阁里面的锦旗，端木正带伤上场。白莲带人闯入山长室窃取机密，恩珠等人撞破引发两个书院混战，蓬莱书院阴谋败露被迫离开。钦差将阵亡将士的抚恤金交给府城官兵，岂料蒙面人杀死官兵夺走这批黄金。张谊等人暗中调查，他们发现杀手的武器是军方才有的装备，校尉怀疑杀手和钦差有关。

张谊等人暗中搜查钦差住所却毫无发现，侍卫长连夜打造兵器显得颇为可疑。翌日张谊拦路阻止钦差出城，他当众宣称被盗黄金就藏在钦差的车上。张谊连着搜查两次，最终赌上性命才从马车上搜出黄金，窃取黄金的真凶就此曝光。富商赵甲的儿子被山匪绑架，山匪要求在塔楼交易赎金，校尉怀疑城中有山匪内应。在重兵把守之下，箱子中的黄金仍旧失踪。山匪释放人质，人质坦白被绑架的原因是藏宝图。

官兵进山搜查山匪，却中埋伏纷纷遇害。张谊一行根据地图找到山匪窝点，恩珠仗义射杀山匪救回人质。张谊用赎金诱出内应，岂料内J的身份十分出人意料，当内J的理由竟是资助烈士家属。学子邢宾借了张谊的银子后失踪，随后传来邢宾死亡的消息。张樱验尸发现死者是被剜心而亡，证据显示凶手就是太乙书院的学生。武陵先生在校内设置举报箱，意图借此找出真凶。

武陵和文素看同学们的密信，他们发现学生郭永嘉有作案嫌疑。面对质问，郭永嘉矢口否认杀人之事，但道出帮徐怀查找档案之事。李璟玉等人意识到王恩珠有危险，他们立即分头寻找。徐怀欲杀王恩珠剖心做药引，不曾想被苏醒的王恩珠制服。被捕的徐怀装病越狱，李璟玉将王恩珠软禁起来保护。狡猾的徐怀易容成李璟玉的模样再次杀王恩珠，幸亏李璟玉及时赶至施阻。郭永嘉道出一些有关徐怀的事，张谊推断出徐怀的去向。

张谊和李璟玉到风月场所寻找破案线索，张谊推测出徐怀藏匿于一个深山村庄中。与此同时，急于延续香火的徐怀迎娶了一个丑姑娘。就在徐怀圆房时，端木正闯入坏了好事并联合众人将徐怀抓捕。张谊带同学们到庆州游玩，他们捣毁了一个乞丐窝营救被拐的幼童。张谊等人将乞丐首领高进交给崔伽罗父亲的故交徐太守审问，但是乞丐却没有受到惩罚......

张谊窥视到太守府的侍卫长和高进勾结，并获知和梁军交换信息的大案。太守府上账簿上的一笔转账引起李璟玉的怀疑，崔伽罗闻情感觉惴惴不安。崔伽罗带着众人离开徐家，谁知半路上被徐太守拦住要灭口，幸亏张谊识破更改设置除掉太守。学院师姐弟弟失踪，她向张谊求助找人。张谊立即带着小伙伴去帮师姐找弟弟，他们第一站便向校尉求助。

张谊等人到师姐弟弟若君的学院寻找线索，学院老师道出若君为帮助老乞丐和郑子豪等人发生过争执的事。张谊推断出郑子豪应该知道若君失踪的原因，他们准备从老乞丐处着手调查。通过跟踪老乞丐，张谊等人发现若君已经被郑子豪打死的噩耗。面对老乞丐的指证，郑子豪以证据不足为由拒绝承认罪行。张谊用计撬开一个同学的嘴，郑子豪团伙终落网。张谊行为古怪，李璟玉怀疑他心中藏着事。

养马大户白老爷重金求助张谊寻找绑匪救子，张谊详细探问事情来龙去脉。张谊等人分别跟踪白夫人，白家大姑爷和白家三少奶奶了解情况。综合分析跟踪到的情况，张谊确认白夫人和大姑爷有不清楚关系，并且三少奶奶也有问题。张谊设计使大姑爷等人暴露丑恶面目，白老爷至此才看清身边人。王恩珠和男同学打猎，李璟玉看到后大吃飞醋。与此同时，王恩珠看到李璟玉帮助女同学倍感不悦。

张谊等人来到江南，宋王妃差人面见众人。得知李璟玉被栽赃巫蛊之名软禁，张谊等人找机会见李璟玉了解实情。通过查证张谊等人发现是仆人陷害李璟玉，故而李璟玉的罪名被洗清。李璟玉尽快向父皇提请迎娶王恩珠，宋王听闻一番分析后爽快同意。宋王妃对王恩珠不满，但也更改不了事实。李璟玉帮张谊找神医替张樱治病，拜访时却被告知神医不在江州。李璟玉提出到江州醉仙楼吃饭，张谊看热闹时误接醉仙楼老板独生女的招亲绣球。

张谊被醉仙楼老板逼着入赘，经过和林小姐的一番深谈后脱身。林小姐突然遇害，张谊被当成嫌犯抓了起来，幸亏崔伽罗动用关系将张谊捞出。张谊道出林小姐有身孕之事，继而众人分头行动寻找相关线索。李璟玉发现武平县主横刀夺爱之事，继而综合张谊的发现他们推断出真凶是武平县主。在证据面前，武平县主伏法。随着接触的加深，张谊和崔伽罗恋情愈来愈明显。

张谊等人刚到书院，校尉赶至声称一个叫墨六的盗墓贼要见端木正。端木正请求校尉给墨六将功赎罪的机会，校尉答应。端木正叫来张谊等人帮忙，他们和墨六一起入古墓寻找则天宝藏线索。张谊等人闯过古墓中的两重机关，古墓中的石门突然关闭将张谊等人分成两拨，此刻墨六露出狡黠笑容道出他的计谋，痛心的端木正只得将小七要杀自己的旧事道出。

听闻端木正和小七之间的真实故事，墨六十分激动。危险一步步逼近，李璟玉因忘记开锁流程导致触动机关。危急时刻，石门突然打开，端木正等人逃出，唯独不见张谊。当众人逃出后发现是张谊救了他们，墨六伏法意识到自己的错误。张谊担心端木正身边有心怀不轨的墨家传人，于是两人暗中对学院学生展开调查。一名叫宗环的学弟接近崔伽罗，张谊警告其远离崔伽罗。宗环失踪，武陵先生以张谊威胁过宗环一事为由命他找人。

端木正等人被楚墨传人白盛算计进入布满机关的房子，端木正被迫和白盛下人子棋。面对狡黠的白盛，端木正沉着应战先救出张谊，白盛被激怒以张樱为人质逼迫端木交出宝物非攻尺。白盛触动机关欲炸死端木正和张樱，没想到端木正和张樱险中逃离。逃跑的白盛被抓，非攻尺重回端木正手中。张樱配制出养颜膏，她将配方卖出赚了一笔钱。校尉道出徐家大小姐被毁容之事，张谊等人闻情惊愕立即就此事展开调查。

张樱断定并非养颜膏导致徐大小姐脸上出疹子，而是药物相克所致。张谊与众人讨论案情，此刻张谊根据线索推断出是有人在洗脸水中加相克草药芫花才导致徐大小姐脸上出疹子。张樱为徐大小姐配药方治疗疹子，继而探知徐老夫人的草药中有芫花的成份。在证据面前，徐老夫人道出下毒毁容孙女的实情。张谊收到一封来信，他匆匆约会故交红娘子。得知红娘子的处境，张谊带她暂回书院躲避追杀。

石主簿意外坠崖而亡，端木正和张樱偷偷检查石府马车和马匹发现两者皆被人动了手脚。张谊怀疑石主簿之死与老知县有关，他设计从老知县的下属处诈取老知县的犯罪证据。老知县绳之以法，红娘子的险境解除。六个幼童被害，校尉求助张谊等人破案。张谊等人发现孩子们的死因是中毒而亡，他们根据毒草线索展开调查。

校尉带李璟玉到Du场查账，但没有发现Du场有任何不妥之事。张谊和端木正假扮Du徒深入Du场，他们故意耍无赖被关押继而发现一个玉牌。张谊通过玉牌找到残杀六子的凶手孩子亲妈，Du徒丈夫此刻方生悔意。张谊等人野炊，崔伽罗算出经过的娶亲男子可能有大祸临头。果不其然，迎亲男子赵大癫狂跳入河中。

张谊等人分析赵大遇害之事，他们完全理不出头绪。张谊到事发地调查，他对死者饭量变大之事产生怀疑。张谊去找赵大妻子张氏了解情况，一个神秘人的逃跑令他将怀疑对象划定为张氏曾经的相好。赵大尸体被挖出，张谊带人抓了张氏和其相好的摆渡人完美破案。码头发生船只爆炸，李璟玉命大躲过一劫。校尉带人搜查爆炸现场发现一封书信，他向张谊等人求助并道出十年前的一桩旧案。

张谊怀疑爆炸案与昔日太乙书院学生有关，他找文素先生了解情况却一无收获。太乙书院两名学生收到家书奔向码头，张谊等人担心有危险急忙奔向码头施阻。张谊等人赶至码头排查船身发现大量炸药，他根据不纯的火药揪出幕后黑手烟火铺老板。张谊混入女生宿舍，和崔伽罗有了暧昧接触机会。文素放烟火取悦武陵，严肃的武陵脸上泛出笑意。张谊等人收到校尉的求助，他们立即奔向校尉府......

接二连三的人被害，张谊等人奉命暗中寻找连环杀人案凶手。张谊和众人勘查太守的管家和寡妇遇害现场，他们发现和寡妇已故丈夫林木匠有莫大关系。经过一系列查证，张谊又发现林木匠的母亲王氏有重大嫌疑。王氏见罪行败露，她独揽罪责，张谊设计引出未死的林木匠。林木匠再次行凶时被张谊发现阻止，连环杀人案完美告破。书院选拔巡逻人员，李璟玉为阻拦王恩珠请求张谊帮忙施阻。

武陵先生宣布挑选入巡逻队的规则，那就是谁先找到巡逻队扮演的黑衣山贼便获得资格。张谊为赚取李璟玉答应的酬劳，他故意误导小组成员。真黑衣山贼闯入藏书阁寻找则天宝藏，他们挟持众多学生作为人质。面对绑匪的跋扈行为，文素先生借交换人质的时机与绑匪同归于尽保护了书院。文素先生亡故，武陵先生和学生们陷入深痛中。黑衣山贼二当家带领弟兄欲闯书院寻仇，这时张谊组织学生们捍卫书院安全。

张谊等人分析绑匪目的，他们怀疑山匪为黑鹞子报仇。武陵和学生们被抓做人质，山匪在后山埋炸药欲将太乙书院夷平。张谊设计抓一个山匪，他用计从其口中得知其中一个炸点位置。经过分析，张谊等人推断出后山其余三个炸点的位置。张谊等人联手摧毁三个炸点，恩珠用神箭将第四处炸点捣毁，土匪二当家无计可施伏法。山长没有点破则天宝藏之谜，而是希望张谊等人不要打则天宝藏的主意。两名学生被害，张谊等人立即就此事展开调查。

武陵先生发现学生之死与则天宝藏有关，她深感痛惜。张谊等人找到山洞下的水潭，端木正欲入水寻找线索，这时一个飞镖飞来张谊护端木正负伤昏厥。一串偏绿泥脚印令张谊产生好奇，他用一瓶药水找到了真凶原东方。在物证下原东方伏法，但却在接受审讯时自杀。张谊和端木正潜入水潭中打先锋找到宝藏藏处，继而折回带众人一起下水寻找宝藏。与此同时，武陵先生担心众人不能经过考验而显得十分焦急。

张谊带领小分队寻找则天宝藏，他们经历重重困境终找到则天宝藏藏处，这时武陵先生和山长现身带着众人解开则天宝藏之谜。原来则天宝藏不是财宝而是失传典籍，在武陵的授意下，张谊等人每人挑选一本书收藏。南北之战一触即发，太乙书院暂停上课遣散学生。李璟玉带着王恩珠回江南，张谊等人则回故乡保护村民。