NSA和CIA在建造新的Intersect，而最重要的“心脏”硬件，解码设备被一帮国际佣兵抢走。Chuck全力试图夺回这项可以让自己回归自由的设备。却不知道，如果新的Intersect顺利建成，那自己原本的保护者，将变成取他性命的人。新的Intersect能顺利建成么？Casey会真的忍心除掉Chuck么？

超市方面，Chuck将选择助力经理的权力交给了Morgan，胡子怪又会用什么令人啼笑皆非的办法选择Buy More的助理经理呢？

为找到真正的Intersect解码设备，Chuck几人需要找到传说中的老特工，蒙哥马利。并在老蒙的指导下引诱一名前KGB特工。Chuck作为一名资深宅男兼书呆子，能够在蒙哥马利的特训下引诱一名见多识广的女间谍么？

超市方面，Lester成为了新一任助理经理，竟然还十分臭屁的在商店门口挂上了“新助理经理上任”的横幅。这么一个权力欲爆发的助理经理，会给Buy More带来什么样的改变呢？

Sarah的前男友Bryce再次出现了，他也带来了关于Fulcrum的最新情报。根据情报，Sarah和Bryce将化妆为新婚夫妇参加嫌疑人的聚会。Sarah将如何平衡Chuck和Bryce的关系？Chuck该如何为了自己的爱情和幸福而努力争取呢？

超市方面，体育用品专卖店的大块头们成功的在Buy More的放映室抢滩登陆了，面对这些膀大腰圆的“敌人”，新上任的Lester有能力解决危机么？

本集讲述了Sarah的过去，最少是她一部分的过去。Sarah的真实身份一直是本剧的一大看点之一，因为间谍最重要的武器，就是他们的秘密身份。当Sarah的过去和身份面临危险，她会如何保护自己？Chuck会帮她隐瞒，还是会趁机了解心中的佳人呢？

超市方面，可爱憨厚的“大麦”为了热衷的淡水钓鱼事业，完全交权给Lester。而急于表现的Lester想到了一个疯狂的降价促销主意。这……

神神道道，怪异无比的Jeff也有一段“明星”史，甚至有间谍为了这段历史大张旗鼓地找上门来。在Chuck调查之后，这款名为“导弹指挥官”的古老游戏和神秘的Fulcrum又有什么联系呢？Jeff能够在压力下爆发，用自己的游戏技巧拯救生命么？

超市方面，新来的效率专家出现在Buy More，对所有员工展开调查。自然而然的，他对所有人的精神领袖，Chuck的行踪非常感兴趣。这会给Chuck的兼职工作带来什么影响呢？

在揭开Sarah历史的一页之后，Chuck那令人心酸的过去也展现在我们的面前。本集，传说已久的前女友Jill正式站在了聚光灯下。Chuck会和她点燃往日的感情么？Jill的出现又会对分分合合的C&S恋有怎样的影响？

超市里，Emmet在经历了“大麦被甜甜圈噎住事件”之后，开展了风风火火的急救训练课程。

据情报，潜伏在CIA内部的Fulcrum成员名单被隐藏在一个FBI监管下的犯罪现场中，Chuck等三人奉命前去取回这项重要的情报。同时Jill的出现迅速的俘获了Chuck的心，两人的感情与日俱增。只是，Jill的身份仿佛不仅仅是Chuck的前女友这么简单。

超市方面，Chuck每次出任务时的借口——“外出电脑装机”由于多次的使用而遭到了Emmett的怀疑。为了证实自己的怀疑，Emmet不惜威胁Morgan来挖掘Chuck的秘密。

可怜的Chuck，好像他所有的约会对象都迟早会被证实和间谍活动有关，这次的老情人Jill也不例外。而且Jill所属的组织正是Chuck近两年来一直试图瓦解的Fulcrum。面对老情人再次的背叛，心地善良的Chuck会如何表现，他能很下心来将Jill抓捕归案么？

超市方面，Morgan,Jeff,lester几人在感恩节这个美国传统节日里竟然没有任何活动，Big Mike索性就将商店交给他们看管。看看这几个活宝能将硕大一个超市搞成什么样子？

Casey作为NSA最优秀的特工之一，拥有一个优秀的师傅。但他却叛变加入了Fulcrum并试图招募Casey。面对自己的昔日的老师，Casey能够坚决地执行任务，并且找到方法胜过教会自己所知一切的人么？

超市方面，面对修炼“偷懒耍滑”大法有成的众多员工，Emmett推出了“月最佳员工”的竞选，以期激励毫无热情的手下。他能如愿以偿么？反对势力的领导，Morgan又会有怎样的应对？

剧情再次试图揭开Sarah的往事。本集，Sarah的父亲，一位颇为成功的long con artist（大骗子）出现在观众的视线中。大家将会看到Bartowski小队客串骗子，以获得目标任务的帐号。颇有点英剧《飞天大盗》（Hustle）的感觉。面临突然的身份变化，Chuck几人能够成功的完成任务，并保全Sarah的掩护身份么？

没想到，Morgan还有相当严重的“承诺恐惧症”。面对Anna的同居要求，他左右为难。这个超级活宝最后会做出怎样的选择，将借来的钞票换成什么东东呢？

圣诞特辑，圣诞前夕的Buy More，在所有人都沉浸在节日的欢乐气氛中时，一个正在和警方展开高速追车逃亡的嫌犯持枪撞进了Buy More的大门，并将包括Ellie Awesome在内的所有员工挟持。面对貌似普通人的嫌犯，出身间谍的Sarah和Casey将如何应对，商场中的其他人又会在危机面前如何表现呢？

著名摇滚歌星Taylor Martin（杜撰的）来到Buy More做宣传，却险些遭到不明身份袭 击 者的 炸 弹 袭 击，Chuck等人奉命调查并保护Taylor的安全。而不安分的Taylor却将Chuck带到了一个酒吧的聚会当中。面对歌星那五光十色的夜生活，Chuck能够保持清醒，保护好Taylor么？

超市内，Morgan等人为了获得Taylor演唱会的贵宾票，展开了轰轰烈烈的寻宝活动。甚至在找到门票之后，为了争夺归属权又开展了富有Buy More特色的铁人三项竞赛。

为了在一个平静无聊的居民区内寻找潜伏的间谍，Chuck和Sarah奉命假扮成新婚夫妇入住到小区内。在这里，从未经历过普通人生活的Sarah第一次体验到“美国梦想”式的郊区生活。只是，在这小区平静的外表下，巨大的危机正悄悄浮出水面……

超市老大“大麦”长久以来作为偷懒之王，一直是超市内众人的典范和支柱。在他突然转变，发奋办公之后，以偷懒为最高行为准则的几人便开始为了“大麦”和他们自身的幸福做起了“红娘”。只是，结果会让所有人满意么？

超市主线再次和间谍主线结合，Morgan的失恋让他开始偏执，甚至准备跟踪前女友Anna。而他选择的行动小组由资深跟踪狂Jeff，Lester，以及自己最好的朋友Chuck组成。而对此行动强烈反对的Chuck很快发现，原来Anna的新男友竟一直被怀疑和黑帮有合作。为了保护Morgan，为了完成任务，面对多年的友情和重要的职责，Chuck将如何选择？

知晓Chuck真实身份的英国特工Cole被Fulcrum抓获，由于安全考虑，Chuck短暂得接受了Sarah的24小时贴身保护。当Cole成功逃脱并和Chuck一起在基地中远程支援执行任务的Sarah和Casey时，两个都对Sarah有好感的大男孩儿开始了针锋相对的竞争。（最少是Chuck在试着竞争）阻止Fulcrum的任务能成功么？这场短暂的三角恋又会如何收场呢？Morgan准备和Chuck合租房子的文件被Anna发现，错以为对方终于长大的Anna欣喜万分。Morgan为了让Anna打消和他一起租房的念头，在Jeff和Lester的出谋划策下，导演了一场场十分雷人的自毁形象的喜剧。Morgan最终会成熟起来，和Anna迈出标志性的一步么？

一心想回归正常生活的Chuck终于找到了可以帮他卸载脑中秘密的人——Orion。可是这个身份神秘的电脑天才似乎并不是那么简单。为了找到他，Chuck自己制作了一个网络搜索系统，并成功了引起了Orion的注意。Chuck能否如愿以偿的找到Orion，对方又是否有能力卸载掉Chuck脑中的秘密呢？

Chuck和Sarah之间的感情在将军看来，已经影响到了二人在外勤任务中的表现。所以将军指派另外一名特工对他们进行名为49-B的表现评估。在评估过程中，几人接受的任务对象却住进了Ellie所在的医院，Chuck等人能否在不被发现的前提下顺利完成任务，49-B的评估又会有何结果？Ellie和Awesome的婚礼即将到来，没有被邀请参加Awesome的单身聚会的Morgan等人用尽一切办法试图参加这个“传说中”的活动，他们甚至不惜借助“绑架”。

在Sarah的帮助下，Chuck终于在十几年后找到了自己的父亲。这个看起来有些邋遢，有些痴狂的老男人，只是个不负责任的父亲？还是真正为子女考虑的无名英雄呢？

为了执行新的任务，Chuck需要混进一所名为Roark的软件公司。而Chuck等人不知道的是，Chuck的父亲竟然和Roark是过去的同事，并指责Roark多次窃取他的拉动成果。

与此同时，喜欢凑热闹的Jeff和Lester也参加了Roark的新操作系统发布会。在如此纷繁复杂的情况下，Chuck能否顺利地完成任务呢？

Chuck的父亲被Fulcrum抓走，为救父亲，不再相信NSA和CIA的Chuck决定用任何可用的方法，不择手段的找寻父亲——他准备和前女友，正在坐牢的Fulcrum特工Jill合作，以她的自由交换父亲被囚禁的信息。Jill会同意这项交易，Chuck能够找到自己的父亲么？

Buy More总部将派人前来检查这段时间Emmett的工作成效，为了与Emmett对抗，众店员在Morgan的带领下展开了一系列的动作。面对这样的不合作行为，Emmett与Morgan私下达成了貌似互利的协议。只是，事实真的如此么？

因为Chuck近期越来越难以控制的表现，将军下令将Chuck带到安全基地看押。作为Chuck最信任的人，原本事业第一的Sarah违反了命令，私自将Chuck带走，并试图协助他找回父亲。同时，Casey接到命令，必须不惜一切代价，将私自逃走的Sarah和Chuck抓回，死活不论。在这关键的时刻，Chuck能否顺利救出父亲，他和Sarah的感情又会有什么样的发展，貌似冷血的Casey会帮助他们，还是服从命令呢？

Morgan中了Emmett设下的圈套，在毫不知情的情况下帮助了Emmett将“大麦”踢下了Buy More的店长宝座。面对Emmett节节进逼的威胁和Big Mike的尴尬处境，Morgan将如何选择才能对得起自己的良心呢？

一切似乎都归于平淡，Chuck将Intersect取了出来，他的父亲，传说中的Orion也毫发无伤的从Fulcrum的基地中成功逃出。坏人邪恶的计划被阻止，一对有情人也终于要步入婚姻的殿堂。但是，一切真的会顺利地进行下去么？本季的大结局，Chuck和他身边的朋友，战友，亲人，爱人，都将何去何从？