高中生侦探工藤新一被称为“日本警察界的救世主”而响誉全国,他帮助警方解决了很多棘手案件。某日,他和青梅竹马小兰一起去坐云霄飞车时遇
到了一起因情生恨凶杀事件,其中,有两名黑衣人引起了工藤的注意,工藤暗中跟踪却被发现,黑衣给他灌下毒药后离开,当被警察发现时,工藤已
变成了小孩儿的模样。
就在警察找不到任何线索想要以自杀结案时,柯南把在案发第一现场找到的领带别针交给警方,这就推翻了自杀的说法,但想要抓到凶手,还需要找
到更加有决定性的证据。这时,柯南注意到了在案发现场发现的绳子,他突然想到什么,就跑到旁边的枯井,一切不出他所料,凶手就是那个人,他
再次将小五郎麻醉,揭秘流传至今的五重塔传说以及凶手!