高中生侦探工藤新一被称为“日本警察界的救世主”而响誉全国,他帮助警方解决了很多棘手案件。某日,他和青梅竹马小兰一起去坐云霄飞车时遇
到了一起因情生恨凶杀事件,其中,有两名黑衣人引起了工藤的注意,工藤暗中跟踪却被发现,黑衣给他灌下毒药后离开,当被警察发现时,工藤已
变成了小孩儿的模样。
朱蒂向小兰和园子坦白了自己FBI的身份,而朱蒂还向小哀提议加入证人保护计划。另一方面从学校回来的路上步美与柯南他们分手后径自往家走。
突然她和一个穿雨衣的男人撞在一起并仓皇离去,而这个人却是杀人嫌疑犯!在警方的调查中步美说出手上发现了一个类似"5"似的记号,而这个记
号究竟又是什么意思呢?