高中生侦探工藤新一被称为“日本警察界的救世主”而响誉全国,他帮助警方解决了很多棘手案件。某日,他和青梅竹马小兰一起去坐云霄飞车时遇
到了一起因情生恨凶杀事件,其中,有两名黑衣人引起了工藤的注意,工藤暗中跟踪却被发现,黑衣给他灌下毒药后离开,当被警察发现时,工藤已
变成了小孩儿的模样。
大和警官和柯南等人立刻找到剩下的三个嫌疑人展开询问,可是每个人都有不在案发现场的证明,与此同时,只身一人在公馆思考赤壁之谜的高明遭
到了凶手的袭击,在失去意识之前他向大和传了一条“孔明之死”的讯息,当柯南他们赶到公馆后这里已是熊熊大火,所幸上原由衣及时将高明救出
,把他送到医院的时候,小兰对医生们不同颜色的衣服表示好奇,而这个问题正好给了柯南和大和提示,让他们破解了赤壁之谜!